153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2263 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  100 
 
 		 412 aa  828    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  46.91 
 
 		 416 aa  341  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  42.48 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  41.78 
 
 		 410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  41.71 
 
 		 423 aa  303  5.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  45.24 
 
 		 425 aa  300  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  41.5 
 
 		 408 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  45.43 
 
 		 411 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  42.02 
 
 		 416 aa  288  8e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  41.01 
 
 		 407 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  42.86 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  43.73 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  43.49 
 
 		 408 aa  279  8e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  41.53 
 
 		 412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  40.93 
 
 		 416 aa  271  1e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  41.13 
 
 		 429 aa  271  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  44.18 
 
 		 430 aa  270  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  42.58 
 
 		 418 aa  266  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  41.86 
 
 		 416 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  42.9 
 
 		 416 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  41.86 
 
 		 416 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  42.9 
 
 		 416 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  39.44 
 
 		 449 aa  261  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  42.99 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  42.31 
 
 		 416 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  38.86 
 
 		 425 aa  260  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  43.29 
 
 		 416 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  45.24 
 
 		 405 aa  253  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  38.11 
 
 		 404 aa  250  3e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  39.14 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  39.02 
 
 		 429 aa  239  6.999999999999999e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  36.12 
 
 		 410 aa  221  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  40.96 
 
 		 418 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  40.96 
 
 		 418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  38.07 
 
 		 425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  39.47 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  32 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  33.92 
 
 		 436 aa  191  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  34.82 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  34.45 
 
 		 432 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  34.22 
 
 		 413 aa  176  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  33.33 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  33.55 
 
 		 413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  33.85 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  33.98 
 
 		 420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  33.64 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  32.72 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  32.72 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  32.72 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  33.55 
 
 		 413 aa  169  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  33.22 
 
 		 413 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  31.53 
 
 		 435 aa  160  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  33.56 
 
 		 398 aa  160  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  33.56 
 
 		 398 aa  160  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  33.22 
 
 		 398 aa  152  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  37.24 
 
 		 407 aa  150  5e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  33.57 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  33.46 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.41 
 
 		 465 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  32.96 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  35.91 
 
 		 448 aa  143  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  30.14 
 
 		 428 aa  140  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  36.07 
 
 		 513 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  28.57 
 
 		 420 aa  127  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  31.48 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  31.93 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  27.76 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.7 
 
 		 379 aa  100  7e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  31.33 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  31.54 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  28.62 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  27.52 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  29.41 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  27.33 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  28.93 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  27.41 
 
 		 412 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1255  metallophosphoesterase  25.73 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.232414 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  27.6 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  25.08 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  26.71 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0761  metallophosphoesterase  27.44 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  26.67 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  27.36 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  25.67 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  25.55 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3342  DNA repair exonuclease-like protein  26.06 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.952092  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  24.38 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  25.67 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  24.01 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  26.97 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  27.18 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  25 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  25.27 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  24.4 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  27.06 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  27.85 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  29.02 
 
 		 385 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  22.07 
 
 		 379 aa  57  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  25.23 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.39 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>