137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1060 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1060  DNA repair exonuclease  100 
 
 		 370 aa  746    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00537439  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  32.98 
 
 		 376 aa  182  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  32.09 
 
 		 376 aa  165  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  23.76 
 
 		 381 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  21.76 
 
 		 379 aa  93.2  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  21.76 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  28.21 
 
 		 374 aa  89.7  7e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  29.35 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  27.81 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  27.81 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  27.81 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  29.55 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  27.48 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  29.07 
 
 		 418 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  27.65 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  25.31 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  29.07 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  27.27 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  27.27 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  29.28 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  27.18 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  28.29 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  26.16 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  27.04 
 
 		 420 aa  67  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  25.81 
 
 		 429 aa  66.2  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  22.04 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0697  metallophosphoesterase  24.01 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  22.3 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  22.3 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  25.56 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  26.01 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  23.62 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  21.41 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  23 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  21.72 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  26.58 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  25.32 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  25 
 
 		 434 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  28.32 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  24.06 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  25.94 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  27.3 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  27.13 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  26.94 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  27.08 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  28.2 
 
 		 513 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  32.41 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  24.02 
 
 		 422 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  26.02 
 
 		 464 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  25.68 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  23.4 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  32.41 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  24.29 
 
 		 420 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  25.2 
 
 		 412 aa  53.9  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.3 
 
 		 465 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  31.48 
 
 		 415 aa  53.1  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  25.98 
 
 		 425 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  26.74 
 
 		 408 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0896  metallophosphoesterase  30.2 
 
 		 402 aa  52.8  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  21.86 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  28.28 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  21.68 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  26.64 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  31.86 
 
 		 375 aa  51.2  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  36.84 
 
 		 412 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  26.37 
 
 		 380 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  20.34 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  35.48 
 
 		 383 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  32.32 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  27.31 
 
 		 411 aa  50.4  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  25.16 
 
 		 368 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  49.18 
 
 		 776 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  29.46 
 
 		 428 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  29.79 
 
 		 375 aa  50.1  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1037  metallophosphoesterase  22.51 
 
 		 362 aa  50.1  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0714312  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  32.29 
 
 		 412 aa  49.7  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2899  metallophosphoesterase  24.23 
 
 		 421 aa  49.7  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  33.68 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  22.5 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1502  metallophosphoesterase  45.9 
 
 		 485 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  24.21 
 
 		 420 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  27.78 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0761  metallophosphoesterase  30.3 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  29.79 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  23.15 
 
 		 428 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  25.17 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  25.4 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  22.91 
 
 		 407 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  24.09 
 
 		 428 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  26.72 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  28.57 
 
 		 435 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  23.76 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  29.67 
 
 		 423 aa  47.4  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  29.79 
 
 		 372 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  22.3 
 
 		 413 aa  47  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  22.76 
 
 		 413 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  31.18 
 
 		 409 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  22.7 
 
 		 418 aa  47  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  24.62 
 
 		 392 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  35.48 
 
 		 390 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>