278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2903 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 		 427 aa  870    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  69.63 
 
 		 412 aa  630  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  68.89 
 
 		 412 aa  607  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  69.98 
 
 		 428 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  68.49 
 
 		 428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  68.49 
 
 		 428 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  67.57 
 
 		 442 aa  568  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  37.79 
 
 		 418 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  37.28 
 
 		 417 aa  270  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  37.99 
 
 		 414 aa  270  4e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  36.52 
 
 		 408 aa  265  8.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  37.16 
 
 		 415 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  35.64 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  35.7 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  35.45 
 
 		 415 aa  239  5e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  28.05 
 
 		 420 aa  167  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  29.9 
 
 		 380 aa  111  3e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  26.34 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  26.21 
 
 		 408 aa  88.6  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  25.06 
 
 		 382 aa  87.4  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  25.06 
 
 		 382 aa  87.4  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  26.36 
 
 		 379 aa  87  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.62 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  26.91 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  25.62 
 
 		 506 aa  84.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  27.4 
 
 		 425 aa  83.6  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  28.21 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  26.25 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  26.25 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  27.16 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  28.25 
 
 		 413 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  27.46 
 
 		 381 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  25.74 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1653  metallophosphoesterase  26.99 
 
 		 270 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  26.25 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  25.24 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  26.25 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  27.24 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  24.51 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  27.72 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  26.28 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.86 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  26.67 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  27.48 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  27.8 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  26.35 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  27.8 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.85 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  27.19 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  27.8 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  28.12 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  27.81 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  25 
 
 		 515 aa  75.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  26.58 
 
 		 382 aa  76.3  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  24.46 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  25.96 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.57 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  28.15 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  27.63 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  25.95 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  26.84 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  25.32 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  27.81 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  25.32 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  26.23 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  26.33 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  25.3 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  25.62 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  25.62 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  25.62 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  25.62 
 
 		 385 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.54 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  25.08 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  26.33 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  24.27 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  24.92 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  25.16 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  27.54 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  28.52 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  25.62 
 
 		 385 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.07 
 
 		 400 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  24.56 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  24.13 
 
 		 453 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  25 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  24.57 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  26.2 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  25.62 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  25.24 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  24.48 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  25.87 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  23.82 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  24.75 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  23.7 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  25.55 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  36.17 
 
 		 407 aa  70.9  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  23.1 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  24.83 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  24.52 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  24.21 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  24.52 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>