More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0749 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  100 
 
 		 397 aa  801    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  27.38 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  30.69 
 
 		 421 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  30.85 
 
 		 421 aa  106  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  31.65 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  30.53 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  29.84 
 
 		 435 aa  90.9  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  42.24 
 
 		 776 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.896103 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  28.74 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  28.33 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  26.4 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  27.31 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  27.89 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  23.81 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  26.94 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  24.63 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  26.57 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  26.57 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  25.71 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  26.36 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  24.34 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  26.36 
 
 		 432 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  26.36 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  24.5 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  36.44 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  26.2 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  25.97 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  21.81 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  26.36 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  26.94 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  27.42 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  28.63 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1502  metallophosphoesterase  37.07 
 
 		 485 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  26.2 
 
 		 413 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  28.62 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  28.23 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  27.89 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  24.89 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  22.62 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1937  metallophosphoesterase  25.23 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.151993  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  24.72 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.62 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  26.69 
 
 		 415 aa  67  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0761  metallophosphoesterase  27.89 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.26 
 
 		 390 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  25.2 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  24.69 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  28.63 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  26.43 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  26.34 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  26.64 
 
 		 408 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  26.21 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  29.58 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0182  metallophosphoesterase  33.04 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  26.8 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  26.62 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  23.77 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  28.12 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  34.65 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  25.71 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2790  metallophosphoesterase  25.31 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  28.52 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  23.08 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  24.33 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  27.84 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  25.75 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2899  metallophosphoesterase  34.78 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1252  DNA repair protein RAD32-like  27.16 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00368978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  25.98 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  26.56 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  24.89 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  24.06 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  23.81 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  27.73 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  26.38 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0370  metallophosphoesterase  32.46 
 
 		 469 aa  62  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.976687  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  26.3 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  25.71 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1244  metallophosphoesterase  27.84 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  22.31 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  24.19 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  37.89 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  34.04 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  25.6 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  25.98 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  24.4 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  34.04 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  34.41 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  36.17 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  25.98 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  26.4 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  25.98 
 
 		 416 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  35.11 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2438  metallophosphoesterase  32.17 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  24.59 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  22.55 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  26.77 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  26.2 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  26.4 
 
 		 386 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  26.2 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>