262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1141 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 		 420 aa  841    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  31.25 
 
 		 414 aa  196  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  35.93 
 
 		 408 aa  196  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  29.86 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  30.5 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  30.58 
 
 		 415 aa  188  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  29.4 
 
 		 418 aa  186  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  31.01 
 
 		 417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  30.68 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  28.71 
 
 		 412 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  28.95 
 
 		 412 aa  168  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  28.05 
 
 		 427 aa  167  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  27.8 
 
 		 428 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  27.83 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  31.75 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  27.3 
 
 		 442 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  25.85 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  28.01 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  27.69 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  25.44 
 
 		 410 aa  99.8  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  29.2 
 
 		 409 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  27.17 
 
 		 442 aa  97.1  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  23.93 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  23.93 
 
 		 400 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  23.57 
 
 		 400 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  23.57 
 
 		 400 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  24.82 
 
 		 400 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  25.81 
 
 		 425 aa  94  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  22.32 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  29.09 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  27.56 
 
 		 405 aa  90.5  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  26.24 
 
 		 392 aa  89.7  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  25.53 
 
 		 412 aa  89.7  9e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  25.23 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  28.07 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  27.24 
 
 		 404 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  25.43 
 
 		 425 aa  88.2  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.5 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  22.6 
 
 		 410 aa  87.8  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  25.92 
 
 		 411 aa  87.4  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  25.11 
 
 		 435 aa  87  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  26.45 
 
 		 393 aa  86.7  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  25.75 
 
 		 400 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  25.07 
 
 		 410 aa  86.7  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  24.72 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  25.25 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  25.75 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  25.75 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  25.75 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  25.75 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  25.75 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  25.75 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3442  exonuclease subunit SbcD  25.08 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289654  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  27.34 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  27.34 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  25.75 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  27.87 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  25.47 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4885  nuclease SbcCD, D subunit  25.06 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.788581 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  25.3 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  23.57 
 
 		 506 aa  82.8  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  23.41 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  24.6 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  23.41 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  23.41 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  24.38 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  27.76 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  26.67 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  26.76 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  22.3 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  24.71 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  25.66 
 
 		 498 aa  80.1  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  24.18 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  28.98 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  23.84 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  26.71 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  26.43 
 
 		 517 aa  78.2  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  26.17 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  23.95 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  23.42 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  24.48 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1100  nuclease SbcCD, D subunit  24.4 
 
 		 537 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  24.46 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  23.49 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  24.37 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  23.8 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  23.75 
 
 		 385 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  27.21 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.62 
 
 		 528 aa  73.6  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  27.3 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  23.4 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1653  metallophosphoesterase  24.06 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  24.54 
 
 		 388 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  24.2 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  25.27 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  24.32 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.07 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  23.24 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  25.62 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  23.47 
 
 		 515 aa  71.2  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>