More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2193 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  87.09 
 
 		 418 aa  701    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 		 417 aa  826    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  59.21 
 
 		 408 aa  457  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  53.19 
 
 		 414 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  39.6 
 
 		 415 aa  300  3e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  40.35 
 
 		 415 aa  294  2e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  40.8 
 
 		 415 aa  293  4e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  38.26 
 
 		 428 aa  285  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  39.02 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  37.74 
 
 		 412 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  37.92 
 
 		 412 aa  281  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  38.54 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  39.17 
 
 		 442 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  37.47 
 
 		 427 aa  275  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  38.97 
 
 		 412 aa  267  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  31.01 
 
 		 420 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  31.29 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  32.99 
 
 		 425 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  26.21 
 
 		 382 aa  94.4  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  26.21 
 
 		 382 aa  94  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  22.31 
 
 		 382 aa  92  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  30.1 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  30.6 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  30.8 
 
 		 379 aa  90.9  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  26.18 
 
 		 387 aa  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  27.72 
 
 		 380 aa  89.4  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  28.27 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  26.75 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.93 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  27.07 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  25.06 
 
 		 404 aa  89  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  26.75 
 
 		 400 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  26.75 
 
 		 400 aa  88.2  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  30 
 
 		 400 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  28.17 
 
 		 400 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3776  nuclease SbcCD, D subunit  28.42 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0285977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  30 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  29.66 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  29.37 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  28.67 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  29.89 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  26.35 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  30.38 
 
 		 386 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  29.35 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  28.67 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1653  metallophosphoesterase  31.16 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  25.57 
 
 		 400 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  27.96 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  27.51 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  30.36 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  25.57 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  25.57 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  25.57 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  25.57 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  25.57 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  25.65 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  25.57 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  28.32 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  26.39 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  28.32 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  25.24 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  32.25 
 
 		 448 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  30.77 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  26.51 
 
 		 506 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  27.92 
 
 		 412 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  26.95 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0984  metallophosphoesterase  27.42 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000094413 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  26.91 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.96 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  24.91 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  25.17 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  27.92 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  25.69 
 
 		 377 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  27.04 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  26.75 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  29.72 
 
 		 513 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  25 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.93 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  27.65 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  26.81 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  25 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  28.78 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  20.45 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  28.73 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  25.69 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  26.71 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  26.42 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  26.32 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  25.22 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  26.73 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  25.97 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  28.37 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.3 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  24.93 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  24.92 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  26.15 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  30.18 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  28.24 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  22.8 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  26.28 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>