272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1921 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  100 
 
 		 421 aa  857    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  96.44 
 
 		 421 aa  828    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  71.95 
 
 		 418 aa  632  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  66.1 
 
 		 421 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  29.62 
 
 		 428 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  31.83 
 
 		 435 aa  160  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1252  DNA repair protein RAD32-like  30.23 
 
 		 425 aa  143  7e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00368978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  31.66 
 
 		 453 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  29.58 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  30.69 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  27.79 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0182  metallophosphoesterase  31.23 
 
 		 436 aa  98.2  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  30 
 
 		 442 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  27.41 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  28.71 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  25.39 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  25.87 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  26.92 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  26.92 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  30.68 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  25.88 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  28.92 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  29.41 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  26.54 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  26.56 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  25.88 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  27.16 
 
 		 427 aa  80.1  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  26.2 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  25.56 
 
 		 432 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  22.67 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  25.56 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  26.86 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  26.56 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1494  metallophosphoesterase  30.34 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  27.04 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  25.4 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  24.92 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  27.04 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  28.93 
 
 		 420 aa  76.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0370  metallophosphoesterase  28.47 
 
 		 469 aa  75.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.976687  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  26.09 
 
 		 423 aa  76.3  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  27.96 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0761  metallophosphoesterase  26.67 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  23.8 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  25 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  26.24 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  26.5 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2899  metallophosphoesterase  24.94 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2438  metallophosphoesterase  29.84 
 
 		 479 aa  73.2  0.000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  27.1 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  36.45 
 
 		 776 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1502  metallophosphoesterase  26.17 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  30.5 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  24.16 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  27.57 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  28.97 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  28.41 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  26.67 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  27.24 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  27.57 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  27.3 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  23.78 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  27.89 
 
 		 409 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  27.3 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  26.48 
 
 		 375 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  27.3 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  27.3 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  27.3 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  27.3 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2790  metallophosphoesterase  28.44 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  25.51 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  28.85 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  25.41 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  26 
 
 		 371 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  25.67 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  25.69 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  28.01 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  25.47 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  26.09 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  26.79 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  26.77 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  27.11 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  25.78 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  24.52 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0019  metallophosphoesterase  29.2 
 
 		 438 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.044517 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  27.78 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  25.91 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  26.69 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1244  metallophosphoesterase  24.38 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  25.83 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1080  metallophosphoesterase  24.47 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000000806376  normal  0.987184 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  26.71 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  23.92 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  26.89 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  24.81 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  22.41 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  28.57 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  27.8 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  28.23 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  25.68 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>