259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1724 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  100 
 
 		 418 aa  860    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  72.44 
 
 		 421 aa  635    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  71.95 
 
 		 421 aa  632  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  70.87 
 
 		 421 aa  599  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  32.45 
 
 		 435 aa  172  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  28.64 
 
 		 428 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1252  DNA repair protein RAD32-like  28.95 
 
 		 425 aa  139  8.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00368978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  31.84 
 
 		 453 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  27.14 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  31.65 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  26.98 
 
 		 381 aa  87.4  4e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  29.01 
 
 		 376 aa  86.7  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  27.71 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  27.93 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  28.21 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  25.68 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  27.59 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  30.29 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  27.5 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  24.37 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  24.37 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0370  metallophosphoesterase  29.37 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.976687  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  27.19 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0182  metallophosphoesterase  26.88 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  24.46 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  25.16 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  27.3 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  25.94 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  25.94 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  25.94 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  25.94 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2899  metallophosphoesterase  28.73 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  25.94 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  25.94 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  28.88 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  27.79 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  25.94 
 
 		 400 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  25.4 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  29.17 
 
 		 415 aa  72  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  31 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  27.21 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  26.25 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.3 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  23.1 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  23.28 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  26.76 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  27.7 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.97 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2438  metallophosphoesterase  28.17 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  27.35 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  25.63 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  26.94 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  37.74 
 
 		 776 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  27.47 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  26.65 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1502  metallophosphoesterase  27.68 
 
 		 485 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  25.97 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  26.77 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  24.4 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  25.19 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  25.57 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  24.81 
 
 		 382 aa  67  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  25.56 
 
 		 382 aa  67  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  24.87 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  26.9 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  26.01 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  25.36 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  25.77 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  26.91 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  27.11 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  23.59 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  27.52 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  27.65 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  27.12 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  25.26 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  28.12 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  25.36 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  28.81 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  23.24 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  24.94 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  25.49 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  27.65 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  25.88 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  28.47 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  24.74 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  26.22 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  26.17 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  27.76 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  26.64 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  25.95 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  25.97 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  25.53 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  24.71 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  27.23 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  26.32 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  23.52 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0019  metallophosphoesterase  29.7 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.044517 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  28.78 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  25.99 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1244  metallophosphoesterase  22.57 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>