173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1212 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  100 
 
 
415 aa  832    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0019  metallophosphoesterase  34.2 
 
 
438 aa  226  7e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.044517 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  34.08 
 
 
423 aa  190  4e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1244  metallophosphoesterase  27.42 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  31.43 
 
 
399 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  28.76 
 
 
382 aa  77  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  25.55 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  27.6 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  28.9 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  26.26 
 
 
394 aa  73.9  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  25 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  30.84 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  25.99 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  24.92 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  24.69 
 
 
413 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  29.17 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  25.86 
 
 
432 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  24.54 
 
 
432 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  25.86 
 
 
413 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  28.97 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  27.54 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  24.92 
 
 
432 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  27.86 
 
 
453 aa  70.1  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  26.16 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
435 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  27.2 
 
 
413 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  27.59 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  25.73 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  26.39 
 
 
430 aa  68.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  25.62 
 
 
422 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  27.86 
 
 
390 aa  67  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  27.62 
 
 
423 aa  67  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  26.62 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  25.25 
 
 
464 aa  66.2  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  25 
 
 
413 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  26.87 
 
 
372 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  26.87 
 
 
398 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  23.45 
 
 
418 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  27.94 
 
 
398 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  27.94 
 
 
398 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  23.02 
 
 
416 aa  64.3  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  26.99 
 
 
434 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  24.12 
 
 
407 aa  63.5  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  20.16 
 
 
404 aa  63.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  23.26 
 
 
442 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  25.97 
 
 
418 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  23.08 
 
 
412 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  25.85 
 
 
429 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  23.42 
 
 
428 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  25 
 
 
392 aa  62.4  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1080  metallophosphoesterase  23.31 
 
 
405 aa  62  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000000806376  normal  0.987184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  22.78 
 
 
405 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  30.04 
 
 
337 aa  61.2  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  21.48 
 
 
408 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  25.17 
 
 
416 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  27.23 
 
 
413 aa  60.8  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  24.55 
 
 
416 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  24.91 
 
 
416 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  24.91 
 
 
416 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  24.91 
 
 
416 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  24.75 
 
 
416 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  26.52 
 
 
420 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  24.55 
 
 
416 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  23.49 
 
 
449 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  25.34 
 
 
428 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  23.66 
 
 
436 aa  58.5  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  24.4 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.65 
 
 
379 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0761  metallophosphoesterase  25.1 
 
 
379 aa  58.2  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2438  metallophosphoesterase  24.05 
 
 
479 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  24.52 
 
 
410 aa  57.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  25.34 
 
 
428 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  25.53 
 
 
427 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  24.06 
 
 
416 aa  57  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  21.09 
 
 
412 aa  57  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  23.66 
 
 
380 aa  57  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  25.23 
 
 
412 aa  57  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  21.2 
 
 
422 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  25.74 
 
 
429 aa  56.6  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  23.91 
 
 
418 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0449  metallophosphoesterase  22.65 
 
 
354 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  23.4 
 
 
418 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  26.12 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  34.12 
 
 
402 aa  55.5  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  25.98 
 
 
397 aa  55.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  23.64 
 
 
419 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  22.12 
 
 
374 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  29.57 
 
 
407 aa  54.3  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  21.93 
 
 
412 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  28.84 
 
 
421 aa  54.3  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  30 
 
 
375 aa  54.3  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  25.44 
 
 
391 aa  54.3  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  34.44 
 
 
372 aa  53.5  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  23.48 
 
 
379 aa  53.9  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  25.11 
 
 
416 aa  53.5  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  23.44 
 
 
386 aa  53.5  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.19 
 
 
465 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  22.52 
 
 
425 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  24.34 
 
 
425 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  27.67 
 
 
361 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>