228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2127 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  97.1 
 
 		 379 aa  735    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  100 
 
 		 379 aa  752    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  33.25 
 
 		 381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  31.95 
 
 		 379 aa  187  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  31.91 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  31.58 
 
 		 413 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  31.02 
 
 		 413 aa  145  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  30.03 
 
 		 413 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  31.25 
 
 		 432 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  30.49 
 
 		 432 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  31.91 
 
 		 413 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  30.69 
 
 		 413 aa  144  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  32.28 
 
 		 413 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  32.28 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  28.22 
 
 		 410 aa  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  29.47 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  33.09 
 
 		 413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  25.91 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  30.36 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  29.39 
 
 		 416 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  29.03 
 
 		 416 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  28.16 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  28.16 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  28.88 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  29.43 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  28.16 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  28.62 
 
 		 416 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  24.61 
 
 		 376 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  28.57 
 
 		 398 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  28.57 
 
 		 398 aa  124  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  29.07 
 
 		 411 aa  123  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  26.96 
 
 		 418 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  26.43 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  25.84 
 
 		 429 aa  119  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  29.58 
 
 		 394 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  29.39 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  28.47 
 
 		 418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  30.04 
 
 		 429 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  24.44 
 
 		 405 aa  115  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  25.9 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  27.75 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  28.38 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  26.28 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  30 
 
 		 368 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  25.61 
 
 		 420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  28.77 
 
 		 419 aa  110  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  27.6 
 
 		 413 aa  111  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  23.08 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  25.76 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  31.82 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  28.99 
 
 		 422 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  26.99 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  27.87 
 
 		 416 aa  106  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  23 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  30.13 
 
 		 418 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  26.2 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  27.76 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  30.13 
 
 		 418 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  26.44 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  28.82 
 
 		 416 aa  99.4  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  30.17 
 
 		 464 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  26.81 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  26.64 
 
 		 416 aa  97.8  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  25.08 
 
 		 407 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  24.38 
 
 		 412 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  23.82 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  28.76 
 
 		 411 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  23.24 
 
 		 374 aa  94  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1060  DNA repair exonuclease  21.76 
 
 		 370 aa  93.2  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00537439  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.27 
 
 		 465 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  25.38 
 
 		 420 aa  90.5  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  26.47 
 
 		 449 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  25.75 
 
 		 410 aa  87  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  22.96 
 
 		 513 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  24.5 
 
 		 428 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  24.71 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  27 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  22.65 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  24.78 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  24.19 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  23.08 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  31.17 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  22.46 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  21.5 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  23.79 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  24.6 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  24.38 
 
 		 448 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2573  metallophosphoesterase  20.79 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  25.32 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  23.35 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  25.47 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  25.3 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  23.82 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  25.23 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  37.23 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0896  metallophosphoesterase  28.1 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  28.62 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3141  metallophosphoesterase  21.37 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496941  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  23.94 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  27.23 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>