151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0728 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  100 
 
 		 390 aa  803    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  36.23 
 
 		 413 aa  254  1.0000000000000001e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  37.43 
 
 		 394 aa  236  6e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  37.73 
 
 		 413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  37.59 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  38.1 
 
 		 413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  37.73 
 
 		 413 aa  196  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  37.73 
 
 		 432 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  37.73 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  37.36 
 
 		 413 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  37.73 
 
 		 413 aa  193  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  37.59 
 
 		 413 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  37.28 
 
 		 432 aa  192  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  38.22 
 
 		 413 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  37.05 
 
 		 398 aa  172  9e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  35.69 
 
 		 429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  36.5 
 
 		 398 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  36.5 
 
 		 398 aa  166  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  34.06 
 
 		 422 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  33.42 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.53 
 
 		 465 aa  155  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  32.3 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  35.46 
 
 		 436 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  35.77 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  33.58 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  32.13 
 
 		 513 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  32.09 
 
 		 436 aa  143  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  31.52 
 
 		 420 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  29.39 
 
 		 425 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  32.9 
 
 		 425 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  29.43 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  34.24 
 
 		 416 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  36.13 
 
 		 416 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  33.91 
 
 		 418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  32.63 
 
 		 412 aa  137  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  34.36 
 
 		 416 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  31.52 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  28.83 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  37.07 
 
 		 411 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  34.23 
 
 		 416 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  32.47 
 
 		 435 aa  133  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  34.23 
 
 		 416 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  33.72 
 
 		 416 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  31.66 
 
 		 430 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  32.08 
 
 		 429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  28.03 
 
 		 449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  31.18 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  33.72 
 
 		 416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  33.72 
 
 		 416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  33.61 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  32.49 
 
 		 416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  35.53 
 
 		 416 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  29.67 
 
 		 418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  27.11 
 
 		 410 aa  129  9.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  26.21 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  27.61 
 
 		 411 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  28.62 
 
 		 418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  28.62 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  31.48 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  33.46 
 
 		 464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  26.71 
 
 		 425 aa  116  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  30.77 
 
 		 416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  28.28 
 
 		 428 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  31.68 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  27.24 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  28.57 
 
 		 422 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.44 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.65 
 
 		 379 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  24.36 
 
 		 428 aa  95.1  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  28.22 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  31 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  24.9 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  24.24 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  25.94 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  26.92 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  26.87 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  27.97 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  43.16 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  27.21 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  24.91 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  43.16 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  40 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  25 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  40 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  24.73 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1255  metallophosphoesterase  26.03 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.232414 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  27.86 
 
 		 415 aa  67  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  26.58 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  27.98 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  37.89 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  34.69 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  24.46 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  24.04 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  25.87 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  24.19 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  26.19 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  23.83 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  24.81 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  22.56 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  26.06 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>