107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1710 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  100 
 
 
423 aa  821    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  44.8 
 
 
428 aa  270  4e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  36.77 
 
 
434 aa  204  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1255  metallophosphoesterase  33.64 
 
 
455 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.232414 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  26.76 
 
 
413 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  26.02 
 
 
432 aa  106  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  27.4 
 
 
413 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  26.02 
 
 
413 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  25 
 
 
413 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  27.66 
 
 
432 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  26.36 
 
 
413 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  25.47 
 
 
432 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  31.58 
 
 
425 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  29.24 
 
 
422 aa  96.7  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  26.91 
 
 
435 aa  95.9  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  25.54 
 
 
413 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  29.52 
 
 
436 aa  93.6  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  24.93 
 
 
413 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
429 aa  92.8  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  29.22 
 
 
405 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  22.46 
 
 
413 aa  91.3  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
436 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  28.12 
 
 
420 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  25 
 
 
407 aa  90.5  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  32.34 
 
 
448 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  28.95 
 
 
449 aa  89.7  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  24.23 
 
 
398 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  26.55 
 
 
394 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  24.23 
 
 
398 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  30.14 
 
 
404 aa  87  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  28.19 
 
 
408 aa  86.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  27.15 
 
 
418 aa  86.7  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  31.91 
 
 
513 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  29.02 
 
 
410 aa  84  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  28.23 
 
 
434 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  23.46 
 
 
398 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  27.7 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  24.9 
 
 
390 aa  82.8  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  27.7 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  28.24 
 
 
416 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  27.41 
 
 
416 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  29.32 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  24.07 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  27.11 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  29.6 
 
 
430 aa  79  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  26.71 
 
 
425 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  30.35 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  27.69 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  27.69 
 
 
416 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  26.88 
 
 
429 aa  76.6  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  27.99 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  27.7 
 
 
416 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  27.76 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  27.02 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.69 
 
 
465 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  29.89 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  27.18 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  29.52 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.47 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  28.62 
 
 
419 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  28.88 
 
 
418 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  25.28 
 
 
407 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  27.27 
 
 
422 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  27.69 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  27.72 
 
 
410 aa  66.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  26.5 
 
 
416 aa  66.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  30.62 
 
 
412 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  24.19 
 
 
421 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  23.49 
 
 
464 aa  64.3  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  25.34 
 
 
420 aa  63.5  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  25.56 
 
 
376 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  25.19 
 
 
376 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  28.17 
 
 
416 aa  58.5  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  27.86 
 
 
374 aa  57.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  23.55 
 
 
421 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  25.86 
 
 
416 aa  55.8  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  25.64 
 
 
442 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  23.36 
 
 
375 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  22.83 
 
 
382 aa  53.9  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  24.02 
 
 
337 aa  53.9  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  24.06 
 
 
399 aa  51.6  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  24.92 
 
 
428 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  24.82 
 
 
381 aa  50.4  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  22.14 
 
 
374 aa  50.1  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  24.36 
 
 
379 aa  49.7  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  25.4 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  33.33 
 
 
428 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  30.51 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  25 
 
 
375 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  24.6 
 
 
428 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  23.44 
 
 
377 aa  48.9  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  24.36 
 
 
373 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  24.36 
 
 
373 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  33.33 
 
 
409 aa  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1244  metallophosphoesterase  22.68 
 
 
380 aa  47.4  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  22.1 
 
 
392 aa  47  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  26.38 
 
 
381 aa  46.6  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  28.57 
 
 
412 aa  46.2  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2438  metallophosphoesterase  28.81 
 
 
479 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>