268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_3309 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  85.71 
 
 
412 aa  733    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  100 
 
 
412 aa  847    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  70.2 
 
 
428 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  68.89 
 
 
427 aa  607  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  68.63 
 
 
428 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  70.27 
 
 
442 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2129  nuclease SbcCD, D subunit  68.87 
 
 
428 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.64706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  38.54 
 
 
408 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  39.85 
 
 
418 aa  285  9e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  38.97 
 
 
417 aa  280  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  37.83 
 
 
414 aa  278  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  36.19 
 
 
415 aa  253  3e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  37.53 
 
 
412 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  36.19 
 
 
415 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  35.94 
 
 
415 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  28.95 
 
 
420 aa  168  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  27.78 
 
 
380 aa  95.1  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  31.1 
 
 
425 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  26.06 
 
 
408 aa  87.4  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  26.92 
 
 
421 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  25.08 
 
 
506 aa  84.7  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  29.1 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  28.8 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  25.87 
 
 
421 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  24.7 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  24.52 
 
 
382 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  26.32 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  27.48 
 
 
377 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  25.61 
 
 
405 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  27.99 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1653  metallophosphoesterase  27.34 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  25.5 
 
 
379 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  21.98 
 
 
379 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.57 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  26.17 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  27.27 
 
 
381 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  26.4 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  25.35 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  21.5 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  25.09 
 
 
387 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.88 
 
 
418 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.67 
 
 
387 aa  76.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  27.55 
 
 
390 aa  75.9  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  26.33 
 
 
386 aa  76.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  26.76 
 
 
381 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  27.14 
 
 
372 aa  74.7  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.07 
 
 
400 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  26.24 
 
 
393 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  26.76 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  26.76 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  26.96 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  28.21 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  27.8 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  26.16 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  27.27 
 
 
410 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  24.7 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  24.1 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  28.32 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  25.89 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  25.21 
 
 
515 aa  72.8  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  25.3 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  25.4 
 
 
418 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  24.4 
 
 
400 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  27.78 
 
 
382 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  24.91 
 
 
400 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2561  DNA repair exonuclease-like protein  24.08 
 
 
445 aa  71.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.215391 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  27.78 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  26.71 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  24.68 
 
 
435 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  25.4 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  27.05 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  26.11 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  25.16 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  24.29 
 
 
412 aa  69.7  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  20.58 
 
 
407 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  20.58 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  23.59 
 
 
373 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  27.91 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  28.16 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  25.09 
 
 
400 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  23.59 
 
 
373 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  26.3 
 
 
401 aa  69.7  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  23.23 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  26.89 
 
 
375 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  25.89 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  22.9 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.5 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  25.77 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  23.05 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  26.85 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  22.97 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  24.29 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  23.23 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1575  metallophosphoesterase  26.41 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  24.92 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  25.82 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  25.77 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  24.42 
 
 
379 aa  67  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  28.09 
 
 
385 aa  67  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  26.35 
 
 
400 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>