204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1990 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  100 
 
 
425 aa  825    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  51.41 
 
 
405 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  43.72 
 
 
425 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  45.19 
 
 
416 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  43.25 
 
 
449 aa  280  3e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  48.69 
 
 
411 aa  279  8e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  41.92 
 
 
423 aa  276  5e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  40.49 
 
 
419 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  42.68 
 
 
430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  40.2 
 
 
416 aa  269  8e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  43.02 
 
 
416 aa  268  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  38.94 
 
 
416 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  39.63 
 
 
416 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  42.77 
 
 
418 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  39.17 
 
 
416 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  38.02 
 
 
416 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  40.39 
 
 
412 aa  256  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  38.28 
 
 
416 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  38.28 
 
 
416 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  42.7 
 
 
411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  38.05 
 
 
416 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  36.96 
 
 
410 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  39.94 
 
 
434 aa  248  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  44.55 
 
 
429 aa  248  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  37.94 
 
 
408 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  39.32 
 
 
407 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  39.14 
 
 
416 aa  231  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  39.39 
 
 
412 aa  230  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  41.16 
 
 
408 aa  230  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  36.21 
 
 
404 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  38.19 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  38.59 
 
 
429 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  39.23 
 
 
422 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  31.19 
 
 
436 aa  194  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  35.26 
 
 
418 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  32.4 
 
 
410 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  34.4 
 
 
418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  36.05 
 
 
418 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  29.17 
 
 
432 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  32.27 
 
 
422 aa  170  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  29.17 
 
 
432 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  28.57 
 
 
413 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  29.38 
 
 
432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  29.38 
 
 
413 aa  167  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  28.87 
 
 
413 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  28.87 
 
 
413 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  28.57 
 
 
413 aa  166  9e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  28.57 
 
 
413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  28.57 
 
 
413 aa  162  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  29.67 
 
 
413 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  32.76 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  31.58 
 
 
464 aa  144  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  32.21 
 
 
436 aa  142  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.89 
 
 
465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  29.01 
 
 
420 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  28.72 
 
 
413 aa  134  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  26.88 
 
 
435 aa  133  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  31.4 
 
 
420 aa  133  6e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  28.77 
 
 
428 aa  130  6e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  30.8 
 
 
398 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  26.44 
 
 
398 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  26.44 
 
 
398 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  27.96 
 
 
407 aa  121  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  32.65 
 
 
513 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  26.71 
 
 
390 aa  116  6e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  23.08 
 
 
379 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  21.84 
 
 
379 aa  103  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  31.58 
 
 
423 aa  98.2  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  31.21 
 
 
376 aa  94  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  30.41 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  26.51 
 
 
368 aa  79.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  28.11 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  24.62 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  26.49 
 
 
434 aa  77.8  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  26.37 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  28.52 
 
 
374 aa  77  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  28.99 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  26.1 
 
 
442 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  21.14 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  26.43 
 
 
421 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  25.08 
 
 
417 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  25.13 
 
 
412 aa  63.2  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  28.71 
 
 
391 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  25.11 
 
 
409 aa  60.1  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  32.26 
 
 
392 aa  59.7  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3309  nuclease subunit SbcD  26.74 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  25.83 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  35.29 
 
 
393 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  23.63 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  26.51 
 
 
418 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1255  metallophosphoesterase  25.9 
 
 
455 aa  57.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.232414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  28.23 
 
 
408 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  24.88 
 
 
418 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  22.08 
 
 
380 aa  57.4  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  27.3 
 
 
377 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  24.3 
 
 
427 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  24.6 
 
 
421 aa  57  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  25.37 
 
 
395 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  24.73 
 
 
414 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  21.24 
 
 
435 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>