146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3015 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  100 
 
 
449 aa  914    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  45.41 
 
 
411 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  42.67 
 
 
408 aa  302  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  42.36 
 
 
434 aa  295  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  44.32 
 
 
416 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  40.14 
 
 
423 aa  290  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  44.21 
 
 
416 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  41.37 
 
 
419 aa  288  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  41.13 
 
 
430 aa  288  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  41.86 
 
 
429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  44.31 
 
 
416 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  43.62 
 
 
416 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  43.92 
 
 
416 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  43.71 
 
 
416 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  43.71 
 
 
416 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  41.79 
 
 
418 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  43.71 
 
 
416 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  40.62 
 
 
416 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  41.96 
 
 
416 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  43.8 
 
 
425 aa  280  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  38.01 
 
 
425 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  38.77 
 
 
407 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  38.66 
 
 
408 aa  272  8.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  44.63 
 
 
405 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  39.74 
 
 
410 aa  265  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  39.2 
 
 
411 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  41.3 
 
 
412 aa  257  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  40.66 
 
 
412 aa  257  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  38.37 
 
 
404 aa  237  4e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  36.87 
 
 
429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  35.73 
 
 
416 aa  218  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  35.25 
 
 
410 aa  209  9e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  35 
 
 
425 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  33.92 
 
 
418 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  34.16 
 
 
418 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  32.82 
 
 
422 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  33.95 
 
 
413 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  33.7 
 
 
413 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  32.42 
 
 
418 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  34.07 
 
 
413 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  34.43 
 
 
413 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  34.07 
 
 
432 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  33.7 
 
 
432 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  34.07 
 
 
413 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  34.32 
 
 
413 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  33.58 
 
 
413 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  32.97 
 
 
432 aa  170  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  35.29 
 
 
413 aa  169  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  33.45 
 
 
422 aa  167  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  32.84 
 
 
436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  30.52 
 
 
394 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.81 
 
 
465 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  36.64 
 
 
407 aa  143  7e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  35.17 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  35.17 
 
 
398 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  34.32 
 
 
398 aa  140  4.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  30.63 
 
 
428 aa  140  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  28.83 
 
 
435 aa  137  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  29.25 
 
 
436 aa  137  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  28.93 
 
 
420 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  31.43 
 
 
420 aa  133  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  32.2 
 
 
448 aa  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  28 
 
 
390 aa  132  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  30.85 
 
 
513 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  31.69 
 
 
413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  33.88 
 
 
464 aa  121  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.21 
 
 
379 aa  90.9  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  28.95 
 
 
423 aa  90.1  6e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  27.13 
 
 
434 aa  89.7  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.47 
 
 
379 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  28.46 
 
 
376 aa  87.8  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  26.11 
 
 
428 aa  85.5  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  30.14 
 
 
374 aa  83.2  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  30.15 
 
 
381 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  28.27 
 
 
376 aa  77  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  24.75 
 
 
382 aa  72  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  25.77 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  26.2 
 
 
409 aa  66.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0761  metallophosphoesterase  27.35 
 
 
379 aa  62  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  25.71 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  24.76 
 
 
379 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  28.39 
 
 
428 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  26.5 
 
 
442 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  26.13 
 
 
415 aa  61.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  21.9 
 
 
337 aa  61.2  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1255  metallophosphoesterase  23.08 
 
 
455 aa  60.1  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.232414 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  23.49 
 
 
415 aa  59.7  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  24.89 
 
 
380 aa  59.3  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1252  DNA repair protein RAD32-like  27.7 
 
 
425 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00368978  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  30.14 
 
 
380 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  23.92 
 
 
391 aa  57.8  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  29.61 
 
 
380 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  25.74 
 
 
415 aa  57.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  26.69 
 
 
415 aa  57.8  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0019  metallophosphoesterase  26.34 
 
 
438 aa  57.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.044517 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  25.51 
 
 
392 aa  57.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1060  DNA repair exonuclease  26.94 
 
 
370 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00537439  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  24.68 
 
 
428 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  24.41 
 
 
408 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  25.47 
 
 
399 aa  55.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>