137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3627 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  100 
 
 		 407 aa  819    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  71.08 
 
 		 408 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  68.87 
 
 		 408 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  47.68 
 
 		 410 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  48.03 
 
 		 412 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  40.29 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  41.81 
 
 		 423 aa  306  3e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  42.89 
 
 		 416 aa  302  9e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  46.11 
 
 		 411 aa  297  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  41.58 
 
 		 416 aa  290  4e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  43.41 
 
 		 416 aa  289  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  42.71 
 
 		 430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  42.86 
 
 		 411 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  42.38 
 
 		 416 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  42.38 
 
 		 416 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  41.86 
 
 		 416 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  42.38 
 
 		 416 aa  279  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  41.21 
 
 		 412 aa  278  9e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  41.6 
 
 		 416 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  41.79 
 
 		 418 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  41.29 
 
 		 416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  40.05 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  41.86 
 
 		 416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  38.77 
 
 		 449 aa  272  6e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  40.61 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  38.76 
 
 		 425 aa  256  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  38.89 
 
 		 404 aa  256  7e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  40.21 
 
 		 416 aa  250  4e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  38.05 
 
 		 405 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  41.18 
 
 		 429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  39.32 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  35.18 
 
 		 425 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  33.66 
 
 		 410 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  36.75 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  35.08 
 
 		 418 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  34.61 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  33.82 
 
 		 422 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  34.77 
 
 		 422 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  33.05 
 
 		 436 aa  188  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  35.31 
 
 		 420 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  34.74 
 
 		 420 aa  166  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  32.34 
 
 		 436 aa  166  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  31.07 
 
 		 394 aa  161  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  29.25 
 
 		 413 aa  159  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  29.59 
 
 		 413 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  30.24 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  29.25 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  29.25 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  29.55 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  30.54 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  29.59 
 
 		 432 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  29.59 
 
 		 413 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  28.91 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.62 
 
 		 465 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  30.43 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  29.41 
 
 		 413 aa  143  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  29.66 
 
 		 435 aa  143  7e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  33.47 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  33.85 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  33.04 
 
 		 398 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  31.18 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  34.07 
 
 		 513 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  29.77 
 
 		 464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  31.76 
 
 		 398 aa  126  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  31.76 
 
 		 398 aa  126  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  26.6 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.75 
 
 		 379 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.08 
 
 		 379 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  29.62 
 
 		 434 aa  87.4  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  23.83 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  27.55 
 
 		 376 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  26.63 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.89 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  25.11 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  25.28 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  24.82 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  28.74 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  22.44 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  29.21 
 
 		 361 aa  62  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  25.42 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  25.63 
 
 		 396 aa  56.2  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  24 
 
 		 421 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  23.89 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  22.56 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  23.55 
 
 		 368 aa  54.3  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  26.56 
 
 		 445 aa  53.5  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  23.62 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  22.86 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  23.59 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4995  metallophosphoesterase  25.2 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  21.46 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1080  metallophosphoesterase  24.46 
 
 		 405 aa  52.4  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000000806376  normal  0.987184 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  22.1 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2573  metallophosphoesterase  25.83 
 
 		 363 aa  51.6  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  23.93 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  25.59 
 
 		 391 aa  51.2  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  24.01 
 
 		 415 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1255  metallophosphoesterase  24.18 
 
 		 455 aa  50.8  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.232414 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  24.54 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  22.43 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>