216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1380 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  100 
 
 		 398 aa  824    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  79.9 
 
 		 398 aa  686    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  79.9 
 
 		 398 aa  686    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  33.25 
 
 		 413 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  35.49 
 
 		 413 aa  219  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  34.97 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  43.46 
 
 		 413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  34.97 
 
 		 413 aa  216  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  35.84 
 
 		 432 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  34.81 
 
 		 432 aa  216  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  35.32 
 
 		 413 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  42.69 
 
 		 413 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  34.72 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  34.72 
 
 		 432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  36.97 
 
 		 422 aa  190  4e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  39.23 
 
 		 394 aa  190  5e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  33.22 
 
 		 429 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  35.79 
 
 		 513 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  38.25 
 
 		 436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  36.52 
 
 		 465 aa  173  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  37.05 
 
 		 390 aa  172  9e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  35.25 
 
 		 416 aa  166  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  35.59 
 
 		 436 aa  166  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  35.8 
 
 		 448 aa  166  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  34.4 
 
 		 423 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  34.5 
 
 		 422 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  37.04 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  30.25 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  36.91 
 
 		 425 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  29.97 
 
 		 410 aa  157  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  27.93 
 
 		 418 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  32.89 
 
 		 404 aa  156  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  29.94 
 
 		 419 aa  156  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  32.36 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  32.57 
 
 		 416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  31.75 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  35.04 
 
 		 416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  36.05 
 
 		 416 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  33.22 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  31.15 
 
 		 416 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  34.19 
 
 		 416 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  34.62 
 
 		 416 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  34.19 
 
 		 416 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  30.47 
 
 		 418 aa  150  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  33.91 
 
 		 416 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  29.02 
 
 		 410 aa  149  8e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  32.62 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  30.47 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  33.47 
 
 		 411 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  34.16 
 
 		 430 aa  147  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  32.85 
 
 		 435 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  32.69 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  31.17 
 
 		 411 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  31.54 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  32.77 
 
 		 416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  34.32 
 
 		 449 aa  140  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  35.47 
 
 		 429 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  37.02 
 
 		 464 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  28.62 
 
 		 405 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  33.04 
 
 		 407 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  31.47 
 
 		 408 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  30.8 
 
 		 425 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  33.62 
 
 		 416 aa  123  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  28.95 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  26.21 
 
 		 420 aa  119  9e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  30.6 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  28.38 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  32.5 
 
 		 376 aa  113  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  25.06 
 
 		 428 aa  113  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.8 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  30.22 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  28.25 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  23.46 
 
 		 423 aa  82.8  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  27.76 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  27.35 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  28.57 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  24.15 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1255  metallophosphoesterase  24.28 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.232414 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  26.67 
 
 		 392 aa  73.9  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  26.48 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  24.7 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  25.91 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  23.77 
 
 		 395 aa  67  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3342  DNA repair exonuclease-like protein  27.82 
 
 		 442 aa  66.2  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.952092  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  26.83 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  26.87 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  26.64 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  24.82 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  21.21 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  24.85 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1060  DNA repair exonuclease  21.72 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00537439  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  27.27 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  26.02 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  25.44 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  26.57 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  24.83 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2573  metallophosphoesterase  22.51 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0019  metallophosphoesterase  22.04 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.044517 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  28.71 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  30.66 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>