68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3342 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3342  DNA repair exonuclease-like protein  100 
 
 
442 aa  900    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.952092  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  26.76 
 
 
436 aa  109  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  27.53 
 
 
422 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  30.04 
 
 
448 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  40.17 
 
 
413 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  26.32 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  26.83 
 
 
432 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  26.83 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  40.17 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  31.65 
 
 
413 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  39.32 
 
 
432 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  39.32 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  38.46 
 
 
432 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  38.46 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  27.02 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.46 
 
 
465 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  27.9 
 
 
513 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  26.32 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  26.32 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  35.04 
 
 
420 aa  67  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  26.06 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  34.82 
 
 
394 aa  66.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  27.82 
 
 
398 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  33.04 
 
 
464 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
428 aa  63.5  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  29.48 
 
 
436 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  36.46 
 
 
435 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  27.84 
 
 
425 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  24.91 
 
 
410 aa  58.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  36.73 
 
 
376 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  25 
 
 
404 aa  57.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  31.13 
 
 
416 aa  58.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  29.6 
 
 
420 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  26.85 
 
 
419 aa  57  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  27.5 
 
 
390 aa  56.6  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  30.87 
 
 
416 aa  56.6  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  36.44 
 
 
412 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  29.67 
 
 
425 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  32.21 
 
 
411 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  24.7 
 
 
434 aa  56.2  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  26.12 
 
 
418 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  33.93 
 
 
430 aa  55.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  29.85 
 
 
416 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  28 
 
 
416 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  28 
 
 
416 aa  55.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  29.85 
 
 
416 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  29.85 
 
 
416 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  28 
 
 
416 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  33.04 
 
 
418 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  26.12 
 
 
418 aa  53.5  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  33.04 
 
 
413 aa  53.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  23 
 
 
408 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  33.05 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  29.1 
 
 
416 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  29.85 
 
 
429 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  29.61 
 
 
429 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  25.47 
 
 
425 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  23.1 
 
 
418 aa  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  32.63 
 
 
376 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  32.61 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  28.72 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  25.38 
 
 
428 aa  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  30.17 
 
 
422 aa  47.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  29.22 
 
 
405 aa  47  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1255  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
455 aa  44.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.232414 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  26.55 
 
 
410 aa  44.3  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  30 
 
 
449 aa  43.5  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  28.18 
 
 
407 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>