131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4580 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  100 
 
 		 429 aa  871    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  51.05 
 
 		 429 aa  375  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  43.42 
 
 		 423 aa  301  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  42.59 
 
 		 416 aa  287  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  46.45 
 
 		 416 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  44.64 
 
 		 416 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  42.42 
 
 		 416 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  45.95 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  47.23 
 
 		 411 aa  280  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  41.47 
 
 		 416 aa  280  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  44.64 
 
 		 416 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  44.64 
 
 		 416 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  42.42 
 
 		 416 aa  279  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  42.42 
 
 		 416 aa  279  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  43.77 
 
 		 416 aa  273  3e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  41.32 
 
 		 434 aa  272  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  41.04 
 
 		 418 aa  269  8e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  40.45 
 
 		 430 aa  266  8e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  42.82 
 
 		 411 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  43.49 
 
 		 412 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  44.12 
 
 		 408 aa  250  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  41.18 
 
 		 408 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  38.82 
 
 		 419 aa  248  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  41.53 
 
 		 412 aa  237  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  41.18 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  37.89 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  38.28 
 
 		 416 aa  228  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  36.87 
 
 		 449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  40.86 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  37.98 
 
 		 404 aa  214  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  38.59 
 
 		 425 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  35.65 
 
 		 425 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  33.8 
 
 		 418 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  35.69 
 
 		 422 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  35.28 
 
 		 418 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  31.37 
 
 		 422 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  34.27 
 
 		 418 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  33.07 
 
 		 410 aa  178  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  36.43 
 
 		 413 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  35 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  34.89 
 
 		 413 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  35.46 
 
 		 413 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  35.46 
 
 		 413 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  35.46 
 
 		 432 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  34.53 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  34.89 
 
 		 413 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  34.29 
 
 		 413 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  34.64 
 
 		 432 aa  170  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  34.29 
 
 		 432 aa  170  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  30.95 
 
 		 436 aa  169  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  34.04 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  33.33 
 
 		 407 aa  140  6e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  35.47 
 
 		 398 aa  138  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.33 
 
 		 465 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  31.54 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  31.54 
 
 		 398 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  31.38 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  30.95 
 
 		 513 aa  137  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  33.7 
 
 		 420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  31.01 
 
 		 435 aa  136  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  36.8 
 
 		 448 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  30.89 
 
 		 420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  32.08 
 
 		 390 aa  132  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  30.46 
 
 		 413 aa  127  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  32.39 
 
 		 428 aa  125  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  31.94 
 
 		 464 aa  124  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  30.04 
 
 		 379 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.66 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  28.39 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  27.86 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  26.95 
 
 		 374 aa  80.1  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  26.67 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  29.56 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  22.71 
 
 		 337 aa  72  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  25.69 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0019  metallophosphoesterase  25.84 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.044517 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  25.88 
 
 		 381 aa  66.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  26.64 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  23.44 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  19.25 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  24.54 
 
 		 434 aa  63.2  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  26.89 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1060  DNA repair exonuclease  24.06 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00537439  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  25.74 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  26.05 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  23.73 
 
 		 423 aa  53.9  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  24.27 
 
 		 415 aa  53.1  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  27.54 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  25.93 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  24.01 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3342  DNA repair exonuclease-like protein  29.61 
 
 		 442 aa  52.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.952092  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  23.83 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  27.64 
 
 		 417 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  26.32 
 
 		 418 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2903  nuclease SbcCD, D subunit  25.56 
 
 		 427 aa  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0109667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  25.42 
 
 		 408 aa  50.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  25.25 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  25.08 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  24.82 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0348  nuclease SbcCD, D subunit  25.25 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>