146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3236 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  100 
 
 
434 aa  867    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1255  metallophosphoesterase  33.41 
 
 
455 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.232414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  36.77 
 
 
423 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  35.75 
 
 
428 aa  195  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  24.12 
 
 
422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  28.88 
 
 
432 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  28.18 
 
 
436 aa  106  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  30.56 
 
 
436 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  28.27 
 
 
413 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  27.96 
 
 
413 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  27.96 
 
 
413 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  26.56 
 
 
435 aa  103  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  28.62 
 
 
434 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  28.05 
 
 
432 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  28.05 
 
 
413 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  28.08 
 
 
413 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  27.36 
 
 
432 aa  100  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  29.96 
 
 
464 aa  99.8  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  27.48 
 
 
413 aa  99  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
513 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  28.4 
 
 
423 aa  96.3  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  30.14 
 
 
411 aa  96.3  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  27.36 
 
 
413 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  26.74 
 
 
418 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  29.53 
 
 
413 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  31.56 
 
 
448 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  25.62 
 
 
413 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  28.49 
 
 
428 aa  94  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  26.89 
 
 
425 aa  93.2  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  30.38 
 
 
408 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  27.32 
 
 
411 aa  92.8  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.16 
 
 
465 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  30.88 
 
 
418 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  30.88 
 
 
418 aa  90.1  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  27.13 
 
 
449 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  26.93 
 
 
425 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  27.49 
 
 
420 aa  88.2  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  25.75 
 
 
416 aa  87.8  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  29.62 
 
 
407 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  31.36 
 
 
418 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  27.97 
 
 
410 aa  87.4  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  29.07 
 
 
408 aa  86.7  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  26.22 
 
 
398 aa  84  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  26.22 
 
 
398 aa  84  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  26.05 
 
 
420 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  26.7 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  25.61 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  28.93 
 
 
412 aa  80.1  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.78 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  25.52 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  28.25 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.36 
 
 
379 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  25.96 
 
 
422 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  26.05 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  25.63 
 
 
430 aa  79  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  26.49 
 
 
425 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  27.24 
 
 
419 aa  76.3  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  29.35 
 
 
416 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
416 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  26.67 
 
 
410 aa  75.5  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  28.16 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  28.67 
 
 
416 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  29.1 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  28.52 
 
 
416 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  28.52 
 
 
416 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  28.88 
 
 
416 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  24.03 
 
 
429 aa  70.1  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  25.36 
 
 
404 aa  69.7  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  27.41 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  25.91 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  27.98 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  24.19 
 
 
421 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  22.48 
 
 
429 aa  64.7  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  28.48 
 
 
374 aa  63.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.37 
 
 
376 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  23.49 
 
 
421 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  25.9 
 
 
381 aa  58.9  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  24.92 
 
 
416 aa  57  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  27.54 
 
 
385 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  24.85 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  26.16 
 
 
381 aa  55.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  21.99 
 
 
421 aa  54.3  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  23.92 
 
 
397 aa  54.3  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  26.88 
 
 
379 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  26.55 
 
 
381 aa  53.9  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  20.49 
 
 
392 aa  51.2  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  23.03 
 
 
418 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  35.48 
 
 
414 aa  50.4  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  25.44 
 
 
417 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  25.51 
 
 
418 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  35.56 
 
 
409 aa  50.1  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  24.51 
 
 
414 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  23.13 
 
 
375 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  33.33 
 
 
517 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0370  metallophosphoesterase  25.73 
 
 
469 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.976687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  26.09 
 
 
375 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  35.59 
 
 
528 aa  47.4  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  23.15 
 
 
381 aa  47.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  26.81 
 
 
386 aa  47.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  23 
 
 
408 aa  47.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>