163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3623 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  100 
 
 
465 aa  956    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  44.06 
 
 
436 aa  354  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  41.39 
 
 
513 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  42.18 
 
 
448 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  36.55 
 
 
420 aa  244  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  33.33 
 
 
422 aa  227  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  32.56 
 
 
436 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  34.13 
 
 
413 aa  218  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  34.13 
 
 
413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  33.86 
 
 
432 aa  216  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  33.86 
 
 
413 aa  216  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  33.33 
 
 
413 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  33.86 
 
 
413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  33.6 
 
 
432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  33.33 
 
 
413 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
413 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  33.33 
 
 
413 aa  212  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  33.07 
 
 
432 aa  210  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  34.69 
 
 
429 aa  201  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  33.51 
 
 
423 aa  186  9e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
416 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  36.52 
 
 
398 aa  173  5.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  32.87 
 
 
411 aa  171  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  34.78 
 
 
398 aa  171  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  34.78 
 
 
398 aa  171  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  31.48 
 
 
425 aa  170  5e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  28.5 
 
 
464 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  34.3 
 
 
394 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  32.2 
 
 
418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  35.48 
 
 
425 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  32.63 
 
 
416 aa  163  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  35.71 
 
 
422 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  34.46 
 
 
408 aa  158  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  31.97 
 
 
416 aa  157  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  29.01 
 
 
435 aa  157  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  32.58 
 
 
419 aa  157  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  32.29 
 
 
434 aa  156  6e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  31.53 
 
 
390 aa  155  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  33.62 
 
 
407 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  29.81 
 
 
449 aa  152  8.999999999999999e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  32.96 
 
 
408 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  33.86 
 
 
416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  33.33 
 
 
413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  33.44 
 
 
416 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  33.44 
 
 
416 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  37.21 
 
 
416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  37.21 
 
 
416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  33.86 
 
 
416 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  30.69 
 
 
418 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  33.23 
 
 
416 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  29.41 
 
 
412 aa  144  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  30.52 
 
 
420 aa  143  7e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  33.07 
 
 
418 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  33.89 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  31.46 
 
 
411 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  32.51 
 
 
430 aa  140  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  36.5 
 
 
418 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
429 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  30 
 
 
410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  33.21 
 
 
405 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  29.79 
 
 
428 aa  134  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  35.9 
 
 
412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  29.35 
 
 
407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  28.09 
 
 
404 aa  130  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  31.93 
 
 
410 aa  126  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  37.4 
 
 
416 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  29.76 
 
 
428 aa  95.5  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  25.96 
 
 
381 aa  95.5  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  26.16 
 
 
434 aa  92  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.27 
 
 
379 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.85 
 
 
379 aa  91.7  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  28.37 
 
 
376 aa  89.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  32.36 
 
 
368 aa  86.7  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  27.85 
 
 
376 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  27.69 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3342  DNA repair exonuclease-like protein  30.46 
 
 
442 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.952092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  26.54 
 
 
417 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  26.16 
 
 
408 aa  68.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  27.54 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  27.87 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  24.64 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  25 
 
 
386 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  26.59 
 
 
423 aa  65.1  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  23.87 
 
 
415 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  25.45 
 
 
380 aa  65.1  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  26.24 
 
 
395 aa  61.6  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  23.79 
 
 
337 aa  61.6  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  23.28 
 
 
361 aa  61.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0019  metallophosphoesterase  24.27 
 
 
438 aa  60.8  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.044517 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1255  metallophosphoesterase  21.93 
 
 
455 aa  60.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.232414 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  23.64 
 
 
415 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  22.82 
 
 
445 aa  58.9  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  24.05 
 
 
414 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  21.82 
 
 
420 aa  57.4  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  28.52 
 
 
386 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  31.45 
 
 
425 aa  56.6  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3141  metallophosphoesterase  24.45 
 
 
375 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  26.56 
 
 
428 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  22.75 
 
 
377 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  25.83 
 
 
391 aa  54.7  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>