174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1255 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1255  metallophosphoesterase  100 
 
 
455 aa  912    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.232414 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  33.41 
 
 
434 aa  212  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  33.64 
 
 
423 aa  181  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  32.8 
 
 
428 aa  156  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  25.71 
 
 
423 aa  99  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  29.9 
 
 
429 aa  98.2  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  25.44 
 
 
394 aa  92.8  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  27.3 
 
 
422 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  24.42 
 
 
413 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  25.89 
 
 
422 aa  90.9  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  24.09 
 
 
413 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  23.76 
 
 
432 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  23.76 
 
 
413 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  23.76 
 
 
413 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  23.76 
 
 
432 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  23.76 
 
 
432 aa  87.8  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  23.76 
 
 
413 aa  87.8  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  25.74 
 
 
425 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  27.27 
 
 
413 aa  82.8  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  23.1 
 
 
413 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  25.93 
 
 
418 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  23.83 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  23.43 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  25.44 
 
 
464 aa  79.7  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  24.76 
 
 
398 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  24.76 
 
 
398 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  26.43 
 
 
448 aa  79  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  25.73 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  24.28 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  22.26 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  26.42 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  25.72 
 
 
428 aa  70.9  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  26.03 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  25.52 
 
 
513 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  25.57 
 
 
430 aa  69.3  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  25.23 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  23.37 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  26.03 
 
 
390 aa  67.4  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  27.07 
 
 
418 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  24.12 
 
 
434 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  23.46 
 
 
410 aa  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  25.48 
 
 
416 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  25.82 
 
 
407 aa  66.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  25.48 
 
 
416 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  27.12 
 
 
418 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  26.69 
 
 
418 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  24.84 
 
 
416 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  21.09 
 
 
337 aa  64.3  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  24.73 
 
 
416 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  24.7 
 
 
416 aa  63.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  22.29 
 
 
435 aa  63.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  25.09 
 
 
416 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  26.22 
 
 
412 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  25.16 
 
 
416 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  28.39 
 
 
374 aa  61.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  25.09 
 
 
416 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  24.77 
 
 
411 aa  61.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  40 
 
 
395 aa  60.8  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  24.44 
 
 
405 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  21.93 
 
 
465 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  20.54 
 
 
379 aa  60.5  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  21.08 
 
 
379 aa  60.1  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  26.46 
 
 
425 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  23.08 
 
 
449 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  25.35 
 
 
361 aa  59.7  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  23.77 
 
 
436 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  23.05 
 
 
381 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  23.42 
 
 
410 aa  57.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  34.23 
 
 
409 aa  57.8  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  26.18 
 
 
411 aa  57.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  25.9 
 
 
425 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  25.24 
 
 
408 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  26.47 
 
 
416 aa  57.4  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  21.88 
 
 
420 aa  57.4  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  36.26 
 
 
405 aa  57  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  37.5 
 
 
399 aa  56.6  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  38.78 
 
 
776 aa  56.6  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  37.04 
 
 
453 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  24.18 
 
 
397 aa  56.2  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  35.87 
 
 
393 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  37.5 
 
 
400 aa  54.3  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  37.5 
 
 
400 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  37.5 
 
 
400 aa  54.3  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  40.22 
 
 
428 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  40.22 
 
 
408 aa  53.5  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  38.46 
 
 
402 aa  52.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  33.33 
 
 
392 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  23.24 
 
 
392 aa  52.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  41.76 
 
 
383 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  39.56 
 
 
382 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  23.18 
 
 
419 aa  51.2  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  25.2 
 
 
421 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  34.44 
 
 
375 aa  51.2  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  36.26 
 
 
406 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  25.61 
 
 
421 aa  50.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  24.18 
 
 
407 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  39.56 
 
 
381 aa  50.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  37.36 
 
 
381 aa  50.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  34.82 
 
 
381 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  34.82 
 
 
381 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>