199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1148 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  100 
 
 
416 aa  858    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  52.05 
 
 
416 aa  420  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  48.18 
 
 
419 aa  395  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  47.67 
 
 
434 aa  379  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  44.96 
 
 
411 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  51.2 
 
 
425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  45.05 
 
 
416 aa  332  9e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  44.27 
 
 
423 aa  320  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  41.61 
 
 
408 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  44.68 
 
 
429 aa  302  7.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  41.36 
 
 
408 aa  300  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  44.7 
 
 
430 aa  295  9e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  39.71 
 
 
407 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  40.48 
 
 
416 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  40.48 
 
 
416 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  42.32 
 
 
412 aa  287  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  41.67 
 
 
418 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  39.76 
 
 
416 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  40 
 
 
416 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  43.82 
 
 
416 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  39.52 
 
 
416 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  43.82 
 
 
416 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  41.78 
 
 
411 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  40.62 
 
 
449 aa  281  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  37.92 
 
 
410 aa  277  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  43.77 
 
 
429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  39.53 
 
 
425 aa  271  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  39.72 
 
 
412 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  37.17 
 
 
405 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  38.74 
 
 
404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  37.96 
 
 
416 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  35.26 
 
 
410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  35.4 
 
 
425 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  34.16 
 
 
422 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  36.71 
 
 
418 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  35.9 
 
 
418 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  35.46 
 
 
413 aa  190  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  28.88 
 
 
422 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  36.16 
 
 
418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  33.64 
 
 
413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  33.64 
 
 
432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  33.64 
 
 
413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  33.64 
 
 
432 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  34 
 
 
413 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  30.52 
 
 
436 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  33.64 
 
 
413 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  29.27 
 
 
420 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  32.79 
 
 
432 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  32.47 
 
 
413 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  38.24 
 
 
413 aa  179  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  33.23 
 
 
413 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  32.54 
 
 
436 aa  167  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.97 
 
 
465 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  36.48 
 
 
398 aa  157  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  36.48 
 
 
398 aa  157  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  31.27 
 
 
428 aa  156  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  38.4 
 
 
394 aa  155  9e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  30.21 
 
 
420 aa  153  7e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  36.05 
 
 
398 aa  152  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  33.85 
 
 
448 aa  146  9e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  36.55 
 
 
413 aa  143  5e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  29.87 
 
 
435 aa  136  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  34.98 
 
 
464 aa  133  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  32.49 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  31.84 
 
 
407 aa  124  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  31.88 
 
 
513 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.64 
 
 
379 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.91 
 
 
379 aa  96.7  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  30.89 
 
 
376 aa  92.8  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  28.37 
 
 
428 aa  89  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
376 aa  87.8  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  28.26 
 
 
428 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  22.37 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  28.1 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  26.78 
 
 
381 aa  77  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  28.98 
 
 
434 aa  76.6  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  29.32 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  26.16 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  25.86 
 
 
408 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  26.6 
 
 
361 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  27.2 
 
 
361 aa  67  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  25.35 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  26.52 
 
 
423 aa  65.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  26.75 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  27.16 
 
 
368 aa  65.1  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  25.98 
 
 
415 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  25.98 
 
 
415 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  26.88 
 
 
453 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  28.47 
 
 
442 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  22.32 
 
 
415 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  26.88 
 
 
412 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  25.81 
 
 
399 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.55 
 
 
371 aa  61.6  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  23.91 
 
 
395 aa  60.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1252  DNA repair protein RAD32-like  23.69 
 
 
425 aa  60.5  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00368978  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  24.82 
 
 
414 aa  60.1  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1080  metallophosphoesterase  27.41 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000000806376  normal  0.987184 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  25.47 
 
 
381 aa  58.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  24.44 
 
 
373 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  24.44 
 
 
373 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>