217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1227 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  100 
 
 		 371 aa  744    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  58.36 
 
 		 374 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  54.4 
 
 		 380 aa  383  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  55.26 
 
 		 380 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  53.8 
 
 		 380 aa  352  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5216  metallophosphoesterase  51.48 
 
 		 370 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  45.79 
 
 		 377 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4995  metallophosphoesterase  41.33 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2303  metallophosphoesterase  41.35 
 
 		 373 aa  216  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0159679 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3141  metallophosphoesterase  37.22 
 
 		 375 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496941  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5392  metallophosphoesterase  35.05 
 
 		 374 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1249  metallophosphoesterase  41.47 
 
 		 383 aa  193  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  37.8 
 
 		 445 aa  193  5e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0908  exonuclease SbcD  40.64 
 
 		 374 aa  182  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2463  metallophosphoesterase  32.55 
 
 		 385 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  33.24 
 
 		 404 aa  162  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  35.22 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  33.24 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  32.62 
 
 		 361 aa  149  7e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23980  DNA repair exonuclease  32.87 
 
 		 379 aa  143  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289668  normal  0.90712 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2573  metallophosphoesterase  31.34 
 
 		 363 aa  140  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4436  metallophosphoesterase  31.83 
 
 		 383 aa  133  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11303  hypothetical protein  33.33 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.42965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1217  metallophosphoesterase  32.11 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2255  metallophosphoesterase  32.86 
 
 		 382 aa  122  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3935  metallophosphoesterase  32.2 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4009  metallophosphoesterase  32.2 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3950  metallophosphoesterase  32.2 
 
 		 383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838996  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1937  metallophosphoesterase  29.23 
 
 		 375 aa  99.8  7e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.151993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  33.06 
 
 		 376 aa  93.2  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  33.09 
 
 		 376 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  31.29 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  22.52 
 
 		 337 aa  69.3  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  28.15 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.78 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  27.33 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.9 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  28.42 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.17 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  27.12 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  31.1 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  25.89 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  27.43 
 
 		 383 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  27.55 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  25.75 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  26.94 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  27.82 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  23.87 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  26.84 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  27.76 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  26.12 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  24.48 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  26.33 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  24.48 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  26.5 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  26.12 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  26.74 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  29.17 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  25.82 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  23.39 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  25.45 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  25.81 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  23.39 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  29.27 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  25.3 
 
 		 381 aa  57  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  30.43 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  21.43 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.54 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  23.39 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.07 
 
 		 381 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  24.88 
 
 		 413 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  22.83 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  23.79 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  24.15 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  25.36 
 
 		 413 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  25.36 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  35.42 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  28 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  23.77 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  26.47 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  29.29 
 
 		 386 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  25.36 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  28.23 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  27.43 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  28.7 
 
 		 425 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  29.67 
 
 		 449 aa  54.3  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  22.54 
 
 		 374 aa  53.5  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  24.91 
 
 		 381 aa  53.9  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  27.95 
 
 		 381 aa  53.5  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  24.88 
 
 		 413 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  29.71 
 
 		 411 aa  53.1  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  25.08 
 
 		 392 aa  53.1  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  36.17 
 
 		 392 aa  53.1  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  37.11 
 
 		 415 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  35.05 
 
 		 402 aa  53.1  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  29.36 
 
 		 397 aa  52.8  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  25.84 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  26.55 
 
 		 375 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  26.14 
 
 		 422 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  24.09 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>