154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1271 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  100 
 
 		 411 aa  815    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  50.9 
 
 		 423 aa  336  5.999999999999999e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  47.45 
 
 		 416 aa  318  1e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  42.58 
 
 		 418 aa  306  6e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  45.82 
 
 		 408 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  42.71 
 
 		 411 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  41.98 
 
 		 410 aa  300  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  46.01 
 
 		 412 aa  298  9e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  42.78 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  46.11 
 
 		 407 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  43.58 
 
 		 416 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  43.37 
 
 		 416 aa  295  8e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  44.41 
 
 		 429 aa  294  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  43.34 
 
 		 416 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  42.46 
 
 		 425 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  42.48 
 
 		 416 aa  292  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  43.5 
 
 		 434 aa  291  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  43.07 
 
 		 416 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  43.07 
 
 		 416 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  45.56 
 
 		 408 aa  291  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  43.83 
 
 		 416 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  43.96 
 
 		 430 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  42.86 
 
 		 412 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  41.78 
 
 		 416 aa  281  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  42.71 
 
 		 416 aa  273  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  44.55 
 
 		 416 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  41.29 
 
 		 429 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  38.96 
 
 		 449 aa  263  4.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  42.45 
 
 		 405 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  42.7 
 
 		 425 aa  255  8e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  40.21 
 
 		 410 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  38 
 
 		 404 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  37.34 
 
 		 425 aa  240  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  36.54 
 
 		 422 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  37.8 
 
 		 418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  36.84 
 
 		 418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  39.21 
 
 		 418 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  30.29 
 
 		 422 aa  193  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  35.91 
 
 		 432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  35.91 
 
 		 413 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  32 
 
 		 436 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  34.9 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  35.91 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  35.23 
 
 		 432 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  35.22 
 
 		 413 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  35.23 
 
 		 413 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  34.88 
 
 		 413 aa  186  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  35.27 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  34.56 
 
 		 432 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  34.8 
 
 		 413 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  33.69 
 
 		 394 aa  155  9e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  32.04 
 
 		 436 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  29.49 
 
 		 398 aa  150  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  29.49 
 
 		 398 aa  150  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  31.18 
 
 		 420 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  31.1 
 
 		 407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  31.17 
 
 		 398 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.34 
 
 		 465 aa  142  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  27.04 
 
 		 413 aa  140  4.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  30.31 
 
 		 420 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  37.07 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  27.64 
 
 		 428 aa  132  9e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  32.82 
 
 		 448 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  27.44 
 
 		 435 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  26.93 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  34.51 
 
 		 513 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  29.07 
 
 		 379 aa  123  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.82 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  30.14 
 
 		 434 aa  96.3  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  29.29 
 
 		 428 aa  88.2  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  25.24 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  23.75 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  30.35 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  29.34 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  29.55 
 
 		 374 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  24.33 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  27.97 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  25.95 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  27.96 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  24.35 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  28 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  22.3 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  29.8 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  24.45 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  27.9 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  26.84 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1080  metallophosphoesterase  29.41 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000000806376  normal  0.987184 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  24.51 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  23.24 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1255  metallophosphoesterase  24.77 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.232414 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  26.52 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  26.12 
 
 		 392 aa  57  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1060  DNA repair exonuclease  27.08 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00537439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  25.22 
 
 		 421 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1252  DNA repair protein RAD32-like  26.92 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00368978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  25.08 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0019  metallophosphoesterase  25.48 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.044517 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0697  metallophosphoesterase  24.33 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  36.36 
 
 		 418 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  26.15 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>