177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2891 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  100 
 
 
448 aa  887    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  51 
 
 
513 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  42.74 
 
 
465 aa  347  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  41.96 
 
 
436 aa  330  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
436 aa  254  3e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  33.26 
 
 
422 aa  243  6e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  33.04 
 
 
420 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  30.12 
 
 
413 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  30.12 
 
 
413 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  30.12 
 
 
413 aa  208  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  29.88 
 
 
432 aa  206  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  29.88 
 
 
413 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  29.63 
 
 
432 aa  203  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  29.63 
 
 
432 aa  203  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  29.63 
 
 
413 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  29.95 
 
 
413 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  30.37 
 
 
413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  27.65 
 
 
413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  33.74 
 
 
423 aa  186  6e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  34.04 
 
 
425 aa  180  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  32.17 
 
 
429 aa  179  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  28.32 
 
 
435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  39.69 
 
 
418 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  37.98 
 
 
425 aa  171  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  39.69 
 
 
419 aa  170  5e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  34.24 
 
 
411 aa  169  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  38.91 
 
 
418 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  33.09 
 
 
398 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  33.09 
 
 
398 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  35.8 
 
 
398 aa  166  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  36.78 
 
 
418 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  32.04 
 
 
420 aa  162  8.000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  32.16 
 
 
394 aa  159  7e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  25.49 
 
 
464 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  33.95 
 
 
430 aa  157  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  32.3 
 
 
390 aa  156  9e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  35.67 
 
 
416 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  35.67 
 
 
416 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  31.08 
 
 
416 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  32.61 
 
 
422 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  35.37 
 
 
416 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  35.03 
 
 
416 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  35.03 
 
 
416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  30.3 
 
 
418 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  31.25 
 
 
408 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  34.73 
 
 
416 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  29.38 
 
 
416 aa  150  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  30.05 
 
 
434 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  34.47 
 
 
416 aa  146  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  29.25 
 
 
428 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  30.39 
 
 
416 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  31 
 
 
412 aa  144  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  39.37 
 
 
416 aa  144  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  31.18 
 
 
408 aa  143  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  36.1 
 
 
412 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  30.43 
 
 
404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  32.9 
 
 
429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  32.95 
 
 
410 aa  137  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  33.85 
 
 
407 aa  136  8e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  32.2 
 
 
449 aa  134  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  27.11 
 
 
410 aa  133  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  32.31 
 
 
411 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  29.89 
 
 
413 aa  131  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  36.46 
 
 
425 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  34.72 
 
 
405 aa  126  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  28.63 
 
 
407 aa  105  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  28.48 
 
 
428 aa  96.7  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  31.7 
 
 
434 aa  94.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  28.75 
 
 
376 aa  93.2  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  31.28 
 
 
376 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3342  DNA repair exonuclease-like protein  30.04 
 
 
442 aa  91.3  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.952092  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  32.34 
 
 
423 aa  90.5  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  28.06 
 
 
381 aa  89.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  27.86 
 
 
415 aa  84.7  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  29.54 
 
 
418 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  30.43 
 
 
408 aa  83.6  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  27.7 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  32.25 
 
 
417 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1255  metallophosphoesterase  25 
 
 
455 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.232414 
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  28.32 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  21.81 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  21.5 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  27.08 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  26.02 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  27.11 
 
 
368 aa  63.5  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  24.81 
 
 
361 aa  62  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  24.39 
 
 
361 aa  61.6  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  25.27 
 
 
421 aa  61.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  25.15 
 
 
442 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  25.45 
 
 
414 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  27.92 
 
 
391 aa  60.5  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  28.16 
 
 
380 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  27.04 
 
 
374 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  23.57 
 
 
420 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  25.44 
 
 
380 aa  57  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  25.44 
 
 
381 aa  57.4  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  26.19 
 
 
399 aa  56.6  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  23.08 
 
 
421 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  28.29 
 
 
428 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  26.67 
 
 
395 aa  55.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>