182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3493 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  100 
 
 
410 aa  825    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  43.54 
 
 
425 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  43.33 
 
 
422 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  41.85 
 
 
418 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  42.89 
 
 
418 aa  289  7e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  42.89 
 
 
418 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1271  metallophosphoesterase  40.21 
 
 
411 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  36.79 
 
 
411 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  36.9 
 
 
425 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  38.89 
 
 
423 aa  226  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  35.26 
 
 
416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  33.18 
 
 
416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  35.56 
 
 
429 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  38.6 
 
 
412 aa  218  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  33.66 
 
 
407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  35.45 
 
 
412 aa  216  7e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  33.25 
 
 
419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  33.82 
 
 
416 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  35.25 
 
 
449 aa  209  8e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  35.97 
 
 
416 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  37.07 
 
 
416 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  32.43 
 
 
410 aa  203  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  34.73 
 
 
430 aa  202  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  36.78 
 
 
416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  34.71 
 
 
416 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  34.88 
 
 
408 aa  199  5e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  36.49 
 
 
416 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  36.49 
 
 
416 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  36.49 
 
 
416 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  33.16 
 
 
418 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  32.15 
 
 
408 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0050  metallophosphoesterase  33.95 
 
 
416 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  32.49 
 
 
434 aa  182  7e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  32.4 
 
 
425 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4580  metallophosphoesterase  33.07 
 
 
429 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  31.51 
 
 
436 aa  177  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3539  metallophosphoesterase  32.42 
 
 
404 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.892373 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  34.13 
 
 
405 aa  170  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  29.87 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  29.81 
 
 
432 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  31.78 
 
 
413 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  30.12 
 
 
432 aa  163  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  30.12 
 
 
413 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  30.75 
 
 
413 aa  162  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  31.64 
 
 
413 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  32.2 
 
 
413 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  30.12 
 
 
413 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  29.5 
 
 
432 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  29.5 
 
 
413 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  29.97 
 
 
398 aa  157  4e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  30.69 
 
 
422 aa  153  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  34.96 
 
 
413 aa  154  4e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  32.18 
 
 
394 aa  147  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  27.04 
 
 
398 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  27.04 
 
 
398 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  32.73 
 
 
464 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  30.88 
 
 
420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  32.95 
 
 
448 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  28.22 
 
 
379 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.61 
 
 
379 aa  133  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0728  DNA repair exonuclease  33.61 
 
 
390 aa  131  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.040475  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.93 
 
 
465 aa  126  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  28.88 
 
 
407 aa  126  7e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  27.13 
 
 
435 aa  123  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  28.39 
 
 
436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2312  metallophosphoesterase  30.71 
 
 
513 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  31.49 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  27.98 
 
 
428 aa  107  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  28.94 
 
 
376 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  30.09 
 
 
420 aa  94  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  28.32 
 
 
374 aa  90.1  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  30.33 
 
 
368 aa  90.1  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
381 aa  87  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  27.09 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  26.05 
 
 
415 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  27.85 
 
 
442 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  27.34 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0828  metallophosphoesterase  27.18 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281797  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  25.56 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  29.94 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3236  metallophosphoesterase  26.67 
 
 
434 aa  75.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1060  DNA repair exonuclease  25.31 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00537439  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  24.58 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  21.41 
 
 
337 aa  72.8  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  30.86 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  25.9 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  25.14 
 
 
421 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  26.06 
 
 
414 aa  67.8  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3331  exonuclease SbcD  25.73 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.102024 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  25.2 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  26.01 
 
 
418 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1502  metallophosphoesterase  26.15 
 
 
485 aa  66.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  24.91 
 
 
391 aa  66.2  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1710  metallophosphoesterase  27.72 
 
 
423 aa  66.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1255  metallophosphoesterase  23.46 
 
 
455 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.232414 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  24.86 
 
 
420 aa  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  23.92 
 
 
421 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0761  metallophosphoesterase  26.82 
 
 
379 aa  63.2  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2085  nuclease SbcCD, D subunit  26.67 
 
 
428 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  27.67 
 
 
381 aa  62.4  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>