150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1764 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  100 
 
 
377 aa  754    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  45.79 
 
 
371 aa  310  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  45.41 
 
 
380 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  47.86 
 
 
380 aa  300  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  47.86 
 
 
380 aa  298  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5216  metallophosphoesterase  44.17 
 
 
370 aa  295  9e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  46.22 
 
 
374 aa  280  4e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1249  metallophosphoesterase  41.29 
 
 
383 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4995  metallophosphoesterase  37.2 
 
 
378 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2303  metallophosphoesterase  37.9 
 
 
373 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0159679 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  37.97 
 
 
409 aa  182  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3141  metallophosphoesterase  33.42 
 
 
375 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496941  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0908  exonuclease SbcD  33.78 
 
 
374 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153594  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5392  metallophosphoesterase  34.11 
 
 
374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874898  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  35.39 
 
 
361 aa  176  7e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  33.24 
 
 
445 aa  167  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2463  metallophosphoesterase  34.36 
 
 
385 aa  166  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2573  metallophosphoesterase  35.31 
 
 
363 aa  162  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212678  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  33.33 
 
 
404 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  32.58 
 
 
396 aa  149  7e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1217  metallophosphoesterase  30.53 
 
 
379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23980  DNA repair exonuclease  29.92 
 
 
379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289668  normal  0.90712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4436  metallophosphoesterase  31.27 
 
 
383 aa  126  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209331  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11303  hypothetical protein  29.64 
 
 
417 aa  123  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.42965  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2255  metallophosphoesterase  28.9 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1937  metallophosphoesterase  31.99 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.151993  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3935  metallophosphoesterase  30.47 
 
 
383 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4009  metallophosphoesterase  30.47 
 
 
383 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3950  metallophosphoesterase  30.34 
 
 
383 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838996  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  32.78 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  32.28 
 
 
376 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  30.23 
 
 
411 aa  84  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  27 
 
 
379 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.63 
 
 
379 aa  80.1  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  23.61 
 
 
381 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  27.54 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  26.57 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  26.95 
 
 
387 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  27.86 
 
 
382 aa  62.4  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.03 
 
 
386 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  28.99 
 
 
372 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  26.74 
 
 
383 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  27.84 
 
 
382 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  27.54 
 
 
382 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  27.3 
 
 
425 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  27.85 
 
 
386 aa  57.8  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  27.16 
 
 
375 aa  57  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  22.02 
 
 
337 aa  56.6  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.75 
 
 
465 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  25.37 
 
 
379 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  26.97 
 
 
381 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  21.82 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  26.81 
 
 
387 aa  53.5  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  24.88 
 
 
368 aa  53.1  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  34.04 
 
 
379 aa  52.8  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.33 
 
 
390 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  25.51 
 
 
429 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  25.37 
 
 
419 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  26.62 
 
 
379 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  23.45 
 
 
434 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  26.91 
 
 
375 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  24.36 
 
 
377 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  25.71 
 
 
416 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.27 
 
 
381 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  26.74 
 
 
381 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  26.98 
 
 
386 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  34.41 
 
 
435 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  23.98 
 
 
380 aa  50.4  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  38.46 
 
 
390 aa  50.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  25 
 
 
425 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  28.95 
 
 
397 aa  49.7  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  32.97 
 
 
390 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  29.06 
 
 
421 aa  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  36.56 
 
 
406 aa  49.7  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  28.12 
 
 
390 aa  49.7  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  31.58 
 
 
387 aa  49.7  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  23.42 
 
 
464 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  28.29 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  24.32 
 
 
361 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  24.7 
 
 
413 aa  48.9  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.92 
 
 
400 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.4 
 
 
386 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  32.63 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  36.36 
 
 
406 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  24.75 
 
 
381 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  29.06 
 
 
421 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1751  metallophosphoesterase  30.43 
 
 
330 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  28.45 
 
 
421 aa  47.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  25.65 
 
 
381 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  24.36 
 
 
381 aa  47.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  25.65 
 
 
381 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  26.47 
 
 
385 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  25.65 
 
 
381 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  25.65 
 
 
381 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  31.37 
 
 
381 aa  47  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  23.85 
 
 
388 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.65 
 
 
400 aa  46.2  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  28.78 
 
 
423 aa  46.2  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  31.52 
 
 
414 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.65 
 
 
400 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>