197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0908 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0908  exonuclease SbcD  100 
 
 		 374 aa  740    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5392  metallophosphoesterase  60.22 
 
 		 374 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2573  metallophosphoesterase  47.15 
 
 		 363 aa  290  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2303  metallophosphoesterase  45.53 
 
 		 373 aa  255  7e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0159679 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3141  metallophosphoesterase  39.84 
 
 		 375 aa  226  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496941  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4995  metallophosphoesterase  39.13 
 
 		 378 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  36.02 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  34.76 
 
 		 371 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  34.14 
 
 		 377 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  39.04 
 
 		 374 aa  182  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1249  metallophosphoesterase  37.98 
 
 		 383 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  36.56 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5216  metallophosphoesterase  36.84 
 
 		 370 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  36.96 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  33.23 
 
 		 409 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  35.16 
 
 		 445 aa  138  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  31.65 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  32.96 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  30.64 
 
 		 361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2463  metallophosphoesterase  32.49 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1217  metallophosphoesterase  32.36 
 
 		 379 aa  109  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2255  metallophosphoesterase  28.21 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4436  metallophosphoesterase  27.92 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11303  hypothetical protein  28.74 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.42965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23980  DNA repair exonuclease  28.5 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289668  normal  0.90712 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1937  metallophosphoesterase  30.12 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.151993  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3935  metallophosphoesterase  28.77 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4009  metallophosphoesterase  28.77 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3950  metallophosphoesterase  28.88 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838996  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.6 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  27.78 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  24.18 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  30 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  21.65 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  29.29 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  23.26 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  30.04 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  24.92 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  23.84 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  23.62 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  25 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  23.95 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  24.27 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  21.65 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  27.05 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  33.08 
 
 		 408 aa  59.3  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  24.6 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  25.65 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  25.81 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  24.6 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  24.6 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.57 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  27.41 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  35 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  24.6 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  25.96 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.49 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  25.37 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  37.63 
 
 		 414 aa  57  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  25.93 
 
 		 434 aa  57  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  25.96 
 
 		 413 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  24.49 
 
 		 400 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  23.95 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  23.93 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  24.24 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  38.71 
 
 		 506 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  33 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  23.87 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  23.87 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  25.68 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  27.78 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3442  exonuclease subunit SbcD  30.16 
 
 		 483 aa  54.7  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289654  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  26.48 
 
 		 429 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  35.48 
 
 		 388 aa  53.9  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  23.32 
 
 		 400 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  39.39 
 
 		 406 aa  53.5  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  37.63 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  24.9 
 
 		 379 aa  53.5  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  34.21 
 
 		 414 aa  53.1  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  23.74 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  23.74 
 
 		 375 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  29.55 
 
 		 416 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  32.31 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  23.25 
 
 		 515 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  28.1 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  36.17 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  36.17 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  36.17 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.62 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  36.17 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  23.89 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  36.17 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  36.17 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  36.17 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  28.27 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  36.17 
 
 		 400 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  36.17 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  34.41 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 453 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  28.2 
 
 		 415 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>