185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2463 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2463  metallophosphoesterase  100 
 
 
385 aa  761    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4436  metallophosphoesterase  51.54 
 
 
383 aa  322  5e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209331  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3935  metallophosphoesterase  51.8 
 
 
383 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4009  metallophosphoesterase  51.8 
 
 
383 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3950  metallophosphoesterase  51.81 
 
 
383 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838996  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11303  hypothetical protein  48.24 
 
 
417 aa  301  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.42965  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2255  metallophosphoesterase  49.14 
 
 
382 aa  299  7e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23980  DNA repair exonuclease  41.71 
 
 
379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289668  normal  0.90712 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1217  metallophosphoesterase  44.88 
 
 
379 aa  248  9e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.55 
 
 
371 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  34.62 
 
 
377 aa  169  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1937  metallophosphoesterase  36.48 
 
 
375 aa  159  9e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.151993  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  31.47 
 
 
374 aa  143  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  32.5 
 
 
409 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  35.84 
 
 
361 aa  136  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4995  metallophosphoesterase  31.59 
 
 
378 aa  133  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  30.58 
 
 
445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  28.53 
 
 
380 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5392  metallophosphoesterase  36.17 
 
 
374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874898  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5216  metallophosphoesterase  29.17 
 
 
370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2303  metallophosphoesterase  31.94 
 
 
373 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0159679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  30.65 
 
 
380 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1249  metallophosphoesterase  30.16 
 
 
383 aa  124  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3141  metallophosphoesterase  28.15 
 
 
375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496941  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0908  exonuclease SbcD  32.49 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153594  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  29.65 
 
 
380 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  28.57 
 
 
396 aa  112  9e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  27.27 
 
 
404 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2573  metallophosphoesterase  28.81 
 
 
363 aa  106  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212678  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  28.17 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  30.12 
 
 
376 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.62 
 
 
379 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  27.57 
 
 
388 aa  72  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  21.82 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  30.97 
 
 
382 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  29.57 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  29.04 
 
 
386 aa  64.3  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
405 aa  63.9  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  25.91 
 
 
422 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1252  DNA repair protein RAD32-like  26.79 
 
 
425 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00368978  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  23.23 
 
 
397 aa  59.3  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  22.94 
 
 
337 aa  57  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  28.3 
 
 
379 aa  56.6  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3776  nuclease SbcCD, D subunit  29.18 
 
 
387 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0285977  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  27.98 
 
 
416 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  20.4 
 
 
398 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  20.4 
 
 
398 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  22.12 
 
 
398 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  25.22 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  29.92 
 
 
385 aa  54.3  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  25.7 
 
 
515 aa  54.3  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  25.81 
 
 
418 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  25.45 
 
 
418 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  26.38 
 
 
415 aa  53.9  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  27.08 
 
 
416 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  25.81 
 
 
418 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  27.52 
 
 
416 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  27.52 
 
 
416 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  25 
 
 
414 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0170  nuclease SbcCD, D subunit, putative  25.34 
 
 
383 aa  53.1  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  23.51 
 
 
432 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  27.97 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  26.28 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  27.24 
 
 
442 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  25.76 
 
 
387 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  20.98 
 
 
374 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  27.08 
 
 
416 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  24.76 
 
 
415 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  32.11 
 
 
408 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  25.2 
 
 
428 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  23.61 
 
 
379 aa  50.4  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  26.67 
 
 
416 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  25.2 
 
 
429 aa  50.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  27.4 
 
 
415 aa  50.4  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  24.1 
 
 
436 aa  50.1  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  35.87 
 
 
387 aa  49.7  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  23.74 
 
 
390 aa  49.7  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  25.95 
 
 
413 aa  49.7  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  23.02 
 
 
432 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  24.04 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  29.09 
 
 
407 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.85 
 
 
386 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  23.11 
 
 
413 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  35.29 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  27.1 
 
 
382 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  26.16 
 
 
401 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  23.11 
 
 
413 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  27.27 
 
 
372 aa  49.7  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  24.04 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  27.64 
 
 
386 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  24.04 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  22.62 
 
 
413 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  23.11 
 
 
432 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  26.25 
 
 
416 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  23.11 
 
 
413 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.29 
 
 
390 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  23.11 
 
 
413 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  25 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  35.16 
 
 
400 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  27.61 
 
 
425 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>