130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1249 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1249  metallophosphoesterase  100 
 
 		 383 aa  746    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2303  metallophosphoesterase  47.31 
 
 		 373 aa  261  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0159679 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4995  metallophosphoesterase  40.96 
 
 		 378 aa  242  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3141  metallophosphoesterase  39.63 
 
 		 375 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496941  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  41.29 
 
 		 377 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  41.47 
 
 		 371 aa  196  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  40.41 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5392  metallophosphoesterase  36.03 
 
 		 374 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0908  exonuclease SbcD  37.98 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  34.53 
 
 		 380 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2573  metallophosphoesterase  36.94 
 
 		 363 aa  175  9e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  36.57 
 
 		 380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  36.57 
 
 		 380 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5216  metallophosphoesterase  35.42 
 
 		 370 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  32.06 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  31.79 
 
 		 409 aa  136  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  28.94 
 
 		 396 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4436  metallophosphoesterase  31.02 
 
 		 383 aa  126  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  30.37 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2463  metallophosphoesterase  29.31 
 
 		 385 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11303  hypothetical protein  31.33 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.42965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  33.55 
 
 		 361 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2255  metallophosphoesterase  29.84 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1937  metallophosphoesterase  33.22 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.151993  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1217  metallophosphoesterase  29.7 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23980  DNA repair exonuclease  30.93 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289668  normal  0.90712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3935  metallophosphoesterase  29.43 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4009  metallophosphoesterase  29.43 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3950  metallophosphoesterase  28.93 
 
 		 383 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838996  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  30.71 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  30.12 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  30.36 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  29.64 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  29.29 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  21.64 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  27.31 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  26.46 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  37.37 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  19.23 
 
 		 379 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  36.46 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  35.88 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  35.19 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  26.67 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  30.56 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  22.27 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  29.07 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  36.36 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  36.36 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  19.42 
 
 		 379 aa  53.9  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  26.22 
 
 		 375 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  34.62 
 
 		 380 aa  53.9  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  37.61 
 
 		 381 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  35.35 
 
 		 399 aa  53.1  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  28.57 
 
 		 376 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  28.75 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  28.66 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  39.6 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  39.6 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  28.46 
 
 		 376 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  24.86 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  30.33 
 
 		 390 aa  50.8  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.26 
 
 		 386 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  38.61 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  24.59 
 
 		 407 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.73 
 
 		 390 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  25.16 
 
 		 428 aa  50.4  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  33.65 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  29.03 
 
 		 407 aa  50.1  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  29.35 
 
 		 408 aa  50.1  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  28.69 
 
 		 381 aa  49.7  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0301  metallophosphoesterase  32.22 
 
 		 386 aa  49.7  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3765  exonuclease SbcD  28.32 
 
 		 414 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0831731  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3216  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.03 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569023 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  26.42 
 
 		 375 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  25.56 
 
 		 366 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  26.26 
 
 		 412 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  26.26 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1245  metallophosphoesterase  25.48 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0434  exodeoxyribonuclease I subunit D  32.08 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0609998  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  25.44 
 
 		 383 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1557  nuclease SbcCD, D subunit  26.55 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436101  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1585  nuclease SbcCD, D subunit  26.17 
 
 		 412 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583238  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  34.41 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  32.08 
 
 		 392 aa  47  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.61 
 
 		 418 aa  46.6  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1820  metallophosphoesterase  34.44 
 
 		 386 aa  46.6  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  31.06 
 
 		 377 aa  46.6  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0463  nuclease SbcCD, D subunit  31.13 
 
 		 419 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165432  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  24.68 
 
 		 386 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0468  nuclease SbcCD, D subunit  31.13 
 
 		 417 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  23.79 
 
 		 432 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  21.43 
 
 		 465 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  26.42 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  33.7 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1715  exonuclease SbcD  28.02 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  30.21 
 
 		 435 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  29.79 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  20.05 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  31.58 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  24.81 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>