153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5216 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5216  metallophosphoesterase  100 
 
 		 370 aa  746    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  68.3 
 
 		 380 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  68.59 
 
 		 380 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  53.39 
 
 		 380 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  51.48 
 
 		 371 aa  350  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  52.29 
 
 		 374 aa  340  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  44.17 
 
 		 377 aa  295  9e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3141  metallophosphoesterase  38.48 
 
 		 375 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496941  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2303  metallophosphoesterase  41.6 
 
 		 373 aa  209  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0159679 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4995  metallophosphoesterase  35.62 
 
 		 378 aa  199  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5392  metallophosphoesterase  36.68 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0908  exonuclease SbcD  36.84 
 
 		 374 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1249  metallophosphoesterase  35.42 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  33.81 
 
 		 404 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  32.58 
 
 		 445 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  31.64 
 
 		 396 aa  139  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23980  DNA repair exonuclease  32.89 
 
 		 379 aa  138  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289668  normal  0.90712 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2573  metallophosphoesterase  37.66 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  34.98 
 
 		 409 aa  132  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  32.06 
 
 		 361 aa  126  6e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2463  metallophosphoesterase  28.91 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1217  metallophosphoesterase  31.22 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4436  metallophosphoesterase  30.34 
 
 		 383 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1937  metallophosphoesterase  30.43 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.151993  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11303  hypothetical protein  29.89 
 
 		 417 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.42965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2255  metallophosphoesterase  31.2 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.18 
 
 		 376 aa  92.8  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3935  metallophosphoesterase  29.2 
 
 		 383 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4009  metallophosphoesterase  29.2 
 
 		 383 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3950  metallophosphoesterase  28.81 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838996  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  26.74 
 
 		 376 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.26 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  23.27 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  22.97 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  23.61 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  25.28 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  27.65 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  25.16 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  27.24 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  25.11 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  38.3 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  26.79 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  24.4 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  28.85 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  32.98 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  30.53 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  24.89 
 
 		 383 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  28.4 
 
 		 416 aa  53.9  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  25.09 
 
 		 381 aa  53.5  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  23.69 
 
 		 379 aa  53.5  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  21.62 
 
 		 413 aa  53.1  0.000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  24.62 
 
 		 394 aa  53.1  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  24.18 
 
 		 381 aa  53.1  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  26.84 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  29.11 
 
 		 381 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  28.97 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  24.78 
 
 		 414 aa  50.8  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  24.78 
 
 		 414 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  28.11 
 
 		 430 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  32.26 
 
 		 409 aa  50.4  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  32.65 
 
 		 515 aa  50.8  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  24.78 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  25.26 
 
 		 368 aa  50.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  25.63 
 
 		 428 aa  50.4  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  26.81 
 
 		 375 aa  50.4  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.94 
 
 		 381 aa  49.7  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  32.26 
 
 		 406 aa  49.7  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  23.65 
 
 		 380 aa  49.7  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  25.42 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  33.33 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  23.89 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  25.85 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  21.8 
 
 		 381 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  24.29 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  24.29 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  24.8 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  26.35 
 
 		 411 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  26.54 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  35 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  22.14 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  24.72 
 
 		 418 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  36.08 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  28.03 
 
 		 385 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1820  metallophosphoesterase  35.96 
 
 		 386 aa  47.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  24.07 
 
 		 464 aa  47.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  25.42 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  24.7 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  27.52 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  34.74 
 
 		 415 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  26.94 
 
 		 417 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  24.27 
 
 		 382 aa  46.6  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  26.07 
 
 		 425 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0348  nuclease SbcCD, D subunit  35.79 
 
 		 415 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.77 
 
 		 390 aa  46.6  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0984  metallophosphoesterase  34.83 
 
 		 384 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000094413 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  23.17 
 
 		 399 aa  46.2  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  31.91 
 
 		 498 aa  46.2  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  34.34 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  23.6 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  35.35 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>