122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2255 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2255  metallophosphoesterase  100 
 
 
382 aa  758    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4436  metallophosphoesterase  87.99 
 
 
383 aa  629  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209331  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11303  hypothetical protein  73.76 
 
 
417 aa  534  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.42965  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3935  metallophosphoesterase  76.45 
 
 
383 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4009  metallophosphoesterase  76.45 
 
 
383 aa  527  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3950  metallophosphoesterase  77.05 
 
 
383 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838996  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1217  metallophosphoesterase  52.63 
 
 
379 aa  338  9e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2463  metallophosphoesterase  48.31 
 
 
385 aa  299  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23980  DNA repair exonuclease  42.67 
 
 
379 aa  271  1e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289668  normal  0.90712 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1937  metallophosphoesterase  34.82 
 
 
375 aa  149  7e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.151993  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.95 
 
 
371 aa  123  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  28.97 
 
 
377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  32.15 
 
 
445 aa  119  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1249  metallophosphoesterase  29.58 
 
 
383 aa  112  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  32.46 
 
 
374 aa  112  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5392  metallophosphoesterase  29.24 
 
 
374 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874898  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3141  metallophosphoesterase  27.11 
 
 
375 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496941  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5216  metallophosphoesterase  31.56 
 
 
370 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  29.32 
 
 
396 aa  111  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
409 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4995  metallophosphoesterase  27.14 
 
 
378 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0908  exonuclease SbcD  28.64 
 
 
374 aa  106  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153594  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  32.7 
 
 
361 aa  106  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  27.97 
 
 
380 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2573  metallophosphoesterase  31.45 
 
 
363 aa  100  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212678  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2303  metallophosphoesterase  30.63 
 
 
373 aa  99.4  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0159679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  29.3 
 
 
380 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  28.96 
 
 
404 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  28.41 
 
 
380 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  26.48 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  24.91 
 
 
418 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  24.91 
 
 
417 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  25.38 
 
 
415 aa  63.2  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  28.99 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  28.62 
 
 
408 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  23.43 
 
 
390 aa  60.1  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  28.06 
 
 
376 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  27 
 
 
376 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  28.46 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  23.27 
 
 
337 aa  58.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  24.28 
 
 
397 aa  57.4  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  26.26 
 
 
386 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  24.47 
 
 
415 aa  57  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  25.46 
 
 
381 aa  56.6  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  27.44 
 
 
390 aa  56.2  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  24.68 
 
 
398 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  28.15 
 
 
418 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  29.44 
 
 
448 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  29.64 
 
 
406 aa  53.5  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  24.9 
 
 
380 aa  53.1  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  23.45 
 
 
428 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  27.17 
 
 
382 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  34.07 
 
 
421 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.22 
 
 
381 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  27.44 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  24.54 
 
 
415 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  37.9 
 
 
412 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0509  metallophosphoesterase  24.31 
 
 
355 aa  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  26.37 
 
 
387 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  31.25 
 
 
464 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  37.9 
 
 
412 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  27.72 
 
 
386 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  23.89 
 
 
420 aa  51.2  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  32.97 
 
 
421 aa  50.8  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  23.38 
 
 
372 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1585  nuclease SbcCD, D subunit  41.3 
 
 
412 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583238  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  24.38 
 
 
375 aa  49.7  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  24.18 
 
 
398 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  24.18 
 
 
398 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  21.97 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  22.51 
 
 
371 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  30.57 
 
 
385 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  29.5 
 
 
375 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1557  nuclease SbcCD, D subunit  42.39 
 
 
412 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436101  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  27.5 
 
 
405 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  29.67 
 
 
366 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  31.87 
 
 
421 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  23.63 
 
 
375 aa  48.1  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  29.67 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  23.68 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  24.11 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  20.78 
 
 
435 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1820  metallophosphoesterase  32.61 
 
 
386 aa  47.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00514924  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  29.94 
 
 
418 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  28.51 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  24.91 
 
 
429 aa  47  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  23.11 
 
 
380 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  25.45 
 
 
410 aa  46.6  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  28.35 
 
 
425 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  26.14 
 
 
381 aa  46.6  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  24.38 
 
 
404 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  25.25 
 
 
412 aa  46.6  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0984  metallophosphoesterase  30.68 
 
 
384 aa  46.2  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000094413 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.71 
 
 
465 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  25.57 
 
 
408 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  23.15 
 
 
407 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  23.46 
 
 
407 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0301  metallophosphoesterase  27.27 
 
 
386 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  28.81 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  24.48 
 
 
422 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446574 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>