195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0301 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0301  metallophosphoesterase  100 
 
 
386 aa  778    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1820  metallophosphoesterase  87.82 
 
 
386 aa  668    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00514924  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0984  metallophosphoesterase  73.58 
 
 
384 aa  595  1e-169  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000094413 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0357  metallophosphoesterase  70.54 
 
 
385 aa  550  1e-155  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1080  metallophosphoesterase  31.71 
 
 
405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000000806376  normal  0.987184 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  27.18 
 
 
382 aa  90.1  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  31.03 
 
 
381 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  27.3 
 
 
418 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  29.18 
 
 
428 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1244  metallophosphoesterase  23.33 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  27.67 
 
 
375 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  23.95 
 
 
399 aa  76.3  0.0000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  26.49 
 
 
417 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  25.18 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  26.54 
 
 
371 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  26.54 
 
 
380 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  25.91 
 
 
414 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1252  DNA repair protein RAD32-like  26.61 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00368978  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  24.55 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2899  metallophosphoesterase  33.79 
 
 
421 aa  67.8  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  25.79 
 
 
408 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1502  metallophosphoesterase  23.8 
 
 
485 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  25.09 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  25.41 
 
 
386 aa  64.7  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  43.53 
 
 
423 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  29.49 
 
 
423 aa  62.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  30.56 
 
 
776 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
372 aa  60.8  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2790  metallophosphoesterase  41.67 
 
 
404 aa  59.7  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  24.56 
 
 
412 aa  59.7  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0449  metallophosphoesterase  28.33 
 
 
354 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  26.77 
 
 
395 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0761  metallophosphoesterase  27.18 
 
 
379 aa  58.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0370  metallophosphoesterase  37.65 
 
 
469 aa  58.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.976687  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  28.37 
 
 
374 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  24.15 
 
 
379 aa  57.4  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  37.93 
 
 
390 aa  56.6  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  23.83 
 
 
435 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1653  metallophosphoesterase  27.08 
 
 
270 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  25.43 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1494  metallophosphoesterase  26.78 
 
 
488 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  29.33 
 
 
381 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2438  metallophosphoesterase  25.64 
 
 
479 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0182  metallophosphoesterase  27.78 
 
 
436 aa  53.9  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  34.12 
 
 
381 aa  53.5  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  25.98 
 
 
397 aa  53.5  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  25.95 
 
 
387 aa  53.1  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  24.33 
 
 
442 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  25.57 
 
 
406 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  29.52 
 
 
453 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0660  nuclease SbcCD, D subunit  24.19 
 
 
428 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  25.56 
 
 
366 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  40.23 
 
 
379 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1813  metallophosphoesterase  31.46 
 
 
261 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00110244  normal  0.670349 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  35.23 
 
 
409 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  34.48 
 
 
406 aa  50.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1249  metallophosphoesterase  32.22 
 
 
383 aa  50.1  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  34.38 
 
 
428 aa  49.7  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  35.63 
 
 
374 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  33.72 
 
 
425 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  36.78 
 
 
402 aa  48.9  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  39.08 
 
 
425 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6750  metallophosphoesterase  33.96 
 
 
275 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  35.63 
 
 
414 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  35.23 
 
 
393 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  36.78 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  36.78 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  26.81 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  31.4 
 
 
400 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  31.4 
 
 
400 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  32.56 
 
 
375 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  35.71 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0170  nuclease SbcCD, D subunit, putative  36.36 
 
 
383 aa  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  40.23 
 
 
381 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  38.64 
 
 
498 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  35.63 
 
 
409 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  37.36 
 
 
415 aa  47.8  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  36.26 
 
 
420 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  31.4 
 
 
400 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  31.4 
 
 
400 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  31.4 
 
 
400 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43144  predicted protein  27.35 
 
 
542 aa  47.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal  0.938333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  31.4 
 
 
400 aa  47.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  31.4 
 
 
400 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  31.4 
 
 
400 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  31.4 
 
 
400 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  35.29 
 
 
414 aa  47.4  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  33.72 
 
 
414 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  37.08 
 
 
409 aa  47.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  34.48 
 
 
380 aa  47.4  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  29.01 
 
 
380 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  33.72 
 
 
405 aa  47.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  37.5 
 
 
409 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  35.63 
 
 
410 aa  47.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  32.95 
 
 
409 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  34.02 
 
 
407 aa  46.6  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1278  metallophosphoesterase  32.58 
 
 
695 aa  47  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  36.05 
 
 
410 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1822  nuclease SbcCD, D subunit  31.82 
 
 
467 aa  46.6  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  24.43 
 
 
379 aa  46.6  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>