168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5377 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  95 
 
 		 380 aa  704    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  100 
 
 		 380 aa  763    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5216  metallophosphoesterase  67.12 
 
 		 370 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  54.03 
 
 		 380 aa  376  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  53.83 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  55.11 
 
 		 374 aa  359  4e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  47.4 
 
 		 377 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4995  metallophosphoesterase  38.81 
 
 		 378 aa  216  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2303  metallophosphoesterase  42.22 
 
 		 373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0159679 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3141  metallophosphoesterase  37.24 
 
 		 375 aa  201  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496941  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5392  metallophosphoesterase  35.12 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1249  metallophosphoesterase  36.84 
 
 		 383 aa  173  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0908  exonuclease SbcD  36.96 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  32.88 
 
 		 445 aa  160  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  32.74 
 
 		 404 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  35.03 
 
 		 409 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2573  metallophosphoesterase  34.14 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  31.89 
 
 		 396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2463  metallophosphoesterase  29.69 
 
 		 385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1217  metallophosphoesterase  32.94 
 
 		 379 aa  123  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23980  DNA repair exonuclease  29.56 
 
 		 379 aa  113  7.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289668  normal  0.90712 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1937  metallophosphoesterase  31.46 
 
 		 375 aa  109  6e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.151993  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4436  metallophosphoesterase  30.53 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2255  metallophosphoesterase  29.48 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11303  hypothetical protein  28.34 
 
 		 417 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.42965  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  31 
 
 		 376 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3950  metallophosphoesterase  29.01 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838996  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3935  metallophosphoesterase  29.41 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4009  metallophosphoesterase  29.41 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  29 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  26.79 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  26.79 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  26.79 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  27.14 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  26.79 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  27.14 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  26.79 
 
 		 432 aa  62.8  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  27.14 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  26.79 
 
 		 413 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  27.14 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  28.09 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  26.56 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  25.83 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  29.61 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  23.66 
 
 		 381 aa  57  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  28.51 
 
 		 416 aa  57  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  21.9 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  36.36 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  24.33 
 
 		 379 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  27.91 
 
 		 412 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  25.55 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  34.38 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  30.14 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  26.67 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  27.27 
 
 		 379 aa  53.5  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  25.82 
 
 		 381 aa  53.1  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  21.79 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  19.88 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  27.92 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  23.64 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  41.84 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.31 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  39.58 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  27.07 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0348  nuclease SbcCD, D subunit  41.84 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  27.95 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  23.31 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  35.2 
 
 		 406 aa  50.4  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  29.15 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  24.54 
 
 		 407 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  27.24 
 
 		 419 aa  50.4  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.45 
 
 		 381 aa  50.1  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  26.12 
 
 		 383 aa  49.7  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  36.56 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.12 
 
 		 465 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  35.11 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.83 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  34.53 
 
 		 404 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  36.36 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  36.36 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  32.65 
 
 		 515 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  25.21 
 
 		 381 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  24.54 
 
 		 464 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.83 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  36.36 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  33.7 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  36.36 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  35.05 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  24.22 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  36.36 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  36.36 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  36.36 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  35.05 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  32.74 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  36.36 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  36.36 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  26.6 
 
 		 430 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  27.76 
 
 		 386 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  35.05 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>