76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23980 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_23980  DNA repair exonuclease  100 
 
 		 379 aa  751    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289668  normal  0.90712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2255  metallophosphoesterase  42.74 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4436  metallophosphoesterase  43.75 
 
 		 383 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11303  hypothetical protein  44.09 
 
 		 417 aa  253  3e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.42965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2463  metallophosphoesterase  41.71 
 
 		 385 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4009  metallophosphoesterase  42.98 
 
 		 383 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3935  metallophosphoesterase  42.98 
 
 		 383 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3950  metallophosphoesterase  43.82 
 
 		 383 aa  243  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838996  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1217  metallophosphoesterase  42.09 
 
 		 379 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1937  metallophosphoesterase  38.06 
 
 		 375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.151993  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.87 
 
 		 371 aa  143  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5216  metallophosphoesterase  32.89 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  33.03 
 
 		 361 aa  129  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4995  metallophosphoesterase  29.92 
 
 		 378 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  29.92 
 
 		 377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  32.48 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2303  metallophosphoesterase  31.37 
 
 		 373 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0159679 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3141  metallophosphoesterase  27.66 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496941  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5392  metallophosphoesterase  28.91 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  29.48 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  30.89 
 
 		 445 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  30.33 
 
 		 374 aa  107  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  27.51 
 
 		 380 aa  99.4  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  29.49 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2573  metallophosphoesterase  28.91 
 
 		 363 aa  93.6  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1249  metallophosphoesterase  30.93 
 
 		 383 aa  93.2  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  28.53 
 
 		 396 aa  92.4  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0908  exonuclease SbcD  28.44 
 
 		 374 aa  86.7  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  28.12 
 
 		 404 aa  79.7  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  22.75 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  23.32 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  23.2 
 
 		 414 aa  52.8  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.9 
 
 		 379 aa  52.8  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  28.51 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  27.99 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.9 
 
 		 379 aa  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  28.62 
 
 		 377 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1990  metallophosphoesterase  38.81 
 
 		 747 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  27.45 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  26.47 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  26 
 
 		 381 aa  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  32.39 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  27.68 
 
 		 379 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  21.38 
 
 		 381 aa  47  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.52 
 
 		 381 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  33.61 
 
 		 376 aa  47  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  25.97 
 
 		 402 aa  47  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  25.4 
 
 		 376 aa  46.6  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  29.13 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  32.63 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  23.77 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  25.36 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  32.41 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  33.67 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  34.62 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  27.36 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  20.72 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  25.49 
 
 		 399 aa  44.3  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  28.63 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  28.87 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  28.21 
 
 		 418 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0984  metallophosphoesterase  30.68 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000094413 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  25.09 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  23.27 
 
 		 398 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  23.27 
 
 		 398 aa  43.5  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  32.63 
 
 		 416 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  32.63 
 
 		 416 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  32.63 
 
 		 416 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  29.45 
 
 		 423 aa  43.1  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  29.79 
 
 		 421 aa  43.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  21.12 
 
 		 380 aa  42.7  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  35.16 
 
 		 382 aa  42.7  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  32.63 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  27.27 
 
 		 407 aa  43.1  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  32.63 
 
 		 416 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  32.63 
 
 		 416 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>