85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1937 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1937  metallophosphoesterase  100 
 
 		 375 aa  743    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.151993  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11303  hypothetical protein  36.94 
 
 		 417 aa  180  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.42965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23980  DNA repair exonuclease  36.03 
 
 		 379 aa  170  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289668  normal  0.90712 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1217  metallophosphoesterase  36.5 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4009  metallophosphoesterase  34.72 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3935  metallophosphoesterase  34.72 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2463  metallophosphoesterase  35.83 
 
 		 385 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3950  metallophosphoesterase  34.64 
 
 		 383 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838996  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4436  metallophosphoesterase  34.08 
 
 		 383 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2255  metallophosphoesterase  34.15 
 
 		 382 aa  150  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3141  metallophosphoesterase  30.7 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496941  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  34.46 
 
 		 361 aa  129  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  31.93 
 
 		 409 aa  125  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  32.22 
 
 		 377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  32.18 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  30.54 
 
 		 380 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  30.77 
 
 		 380 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5216  metallophosphoesterase  29.26 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  29.23 
 
 		 371 aa  103  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1249  metallophosphoesterase  33.22 
 
 		 383 aa  103  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  29.43 
 
 		 396 aa  102  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5392  metallophosphoesterase  29.27 
 
 		 374 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  30.86 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2303  metallophosphoesterase  30.94 
 
 		 373 aa  90.1  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0159679 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  27.18 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4995  metallophosphoesterase  27.18 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0908  exonuclease SbcD  30.12 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  28.53 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.21 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  25.23 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2573  metallophosphoesterase  27.6 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1502  metallophosphoesterase  24.9 
 
 		 485 aa  57.4  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  28.3 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2899  metallophosphoesterase  29.51 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  30.53 
 
 		 390 aa  53.5  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  25.82 
 
 		 381 aa  53.5  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  24.62 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  26.69 
 
 		 408 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  25.08 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  23.87 
 
 		 416 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  20.99 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  23.61 
 
 		 449 aa  50.8  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  23.87 
 
 		 416 aa  50.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  25.14 
 
 		 425 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  20.58 
 
 		 379 aa  49.7  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  29.37 
 
 		 410 aa  49.7  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  24.83 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  23.7 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  29.94 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5337  metallophosphoesterase  24.19 
 
 		 416 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  23.85 
 
 		 464 aa  47  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  23.87 
 
 		 416 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  23.81 
 
 		 382 aa  46.2  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  32.58 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  23.55 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  28.42 
 
 		 517 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  24.2 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  27.78 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  25.5 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  32.23 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  37 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  23.55 
 
 		 428 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  21.68 
 
 		 392 aa  44.3  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  28.3 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  26.79 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  37.63 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  37.63 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  37.63 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  37.63 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  37.63 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  37.63 
 
 		 400 aa  43.9  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  37.63 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  37.63 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  37.63 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1563  metallophosphoesterase  24.27 
 
 		 430 aa  43.9  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  29.17 
 
 		 515 aa  43.5  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  24.4 
 
 		 415 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  29.84 
 
 		 408 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  30.19 
 
 		 506 aa  43.5  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  29.59 
 
 		 381 aa  43.1  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1269  metallophosphoesterase  35.35 
 
 		 275 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0548527  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.23 
 
 		 528 aa  43.1  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  20.13 
 
 		 382 aa  43.1  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  26.76 
 
 		 412 aa  42.7  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  23.23 
 
 		 416 aa  42.7  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>