127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4009 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3935  metallophosphoesterase  100 
 
 
383 aa  754    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4009  metallophosphoesterase  100 
 
 
383 aa  754    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3950  metallophosphoesterase  98.96 
 
 
383 aa  746    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838996  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2255  metallophosphoesterase  76.44 
 
 
382 aa  545  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4436  metallophosphoesterase  76.5 
 
 
383 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209331  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11303  hypothetical protein  73.83 
 
 
417 aa  537  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.42965  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1217  metallophosphoesterase  54.5 
 
 
379 aa  340  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2463  metallophosphoesterase  50.52 
 
 
385 aa  322  8e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23980  DNA repair exonuclease  43.5 
 
 
379 aa  268  8.999999999999999e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289668  normal  0.90712 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1937  metallophosphoesterase  36.66 
 
 
375 aa  162  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.151993  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.94 
 
 
371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  34.85 
 
 
361 aa  126  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  34.73 
 
 
409 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  30.89 
 
 
377 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  30.96 
 
 
445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2303  metallophosphoesterase  33.44 
 
 
373 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0159679 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1249  metallophosphoesterase  31.07 
 
 
383 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  30.14 
 
 
374 aa  106  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3141  metallophosphoesterase  28.12 
 
 
375 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496941  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  28.35 
 
 
380 aa  102  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5392  metallophosphoesterase  29.46 
 
 
374 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874898  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  30.7 
 
 
396 aa  99.4  9e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4995  metallophosphoesterase  27.81 
 
 
378 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5216  metallophosphoesterase  29.07 
 
 
370 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2573  metallophosphoesterase  30.95 
 
 
363 aa  96.7  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212678  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  28.62 
 
 
404 aa  96.3  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  29.74 
 
 
380 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  30.07 
 
 
380 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0908  exonuclease SbcD  29.05 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153594  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  25.83 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  26.6 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  26.42 
 
 
408 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  27.82 
 
 
386 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  26.07 
 
 
417 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  30.25 
 
 
405 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  21.71 
 
 
337 aa  60.5  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  26.33 
 
 
412 aa  59.7  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  28.14 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  23.08 
 
 
398 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  21.19 
 
 
379 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  31.34 
 
 
390 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  29.79 
 
 
425 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  24.75 
 
 
415 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  36.67 
 
 
418 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22 
 
 
379 aa  57.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  27.12 
 
 
422 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  34.07 
 
 
421 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  29.84 
 
 
448 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  25 
 
 
415 aa  56.2  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  25.71 
 
 
375 aa  55.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  28.38 
 
 
429 aa  56.2  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  23.64 
 
 
415 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  23.81 
 
 
397 aa  56.2  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  30.05 
 
 
418 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  27.49 
 
 
380 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  27.76 
 
 
376 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  28.71 
 
 
379 aa  53.9  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  25.09 
 
 
387 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.82 
 
 
376 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  24.45 
 
 
390 aa  53.9  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  25.75 
 
 
381 aa  53.9  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  19.93 
 
 
398 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  19.93 
 
 
398 aa  53.5  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  28.79 
 
 
406 aa  52.8  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  31.87 
 
 
421 aa  52.8  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  20.06 
 
 
435 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  28.81 
 
 
394 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0509  metallophosphoesterase  25.27 
 
 
355 aa  50.8  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1252  DNA repair protein RAD32-like  24.15 
 
 
425 aa  50.8  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00368978  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  26.59 
 
 
418 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  28.51 
 
 
423 aa  50.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  34.07 
 
 
421 aa  50.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  28.14 
 
 
382 aa  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  35.25 
 
 
416 aa  49.7  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  26.32 
 
 
388 aa  49.7  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  30.11 
 
 
399 aa  49.7  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  35.25 
 
 
416 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  35.25 
 
 
416 aa  49.7  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  34.35 
 
 
416 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  34.35 
 
 
416 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
372 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  34.35 
 
 
416 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  34.74 
 
 
422 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  30.93 
 
 
464 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  29.67 
 
 
375 aa  48.5  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  26.12 
 
 
419 aa  48.9  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  34.44 
 
 
428 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  26.45 
 
 
410 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  26.91 
 
 
381 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  26.1 
 
 
412 aa  47.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  30.64 
 
 
408 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  29.67 
 
 
380 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  27.21 
 
 
383 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
408 aa  47  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.24 
 
 
381 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  26.42 
 
 
404 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  29.62 
 
 
385 aa  46.6  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  22.32 
 
 
382 aa  46.6  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  27.43 
 
 
416 aa  46.6  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>