159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1217 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1217  metallophosphoesterase  100 
 
 		 379 aa  741    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11303  hypothetical protein  51.64 
 
 		 417 aa  339  4e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.42965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2255  metallophosphoesterase  52.04 
 
 		 382 aa  331  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3935  metallophosphoesterase  53.72 
 
 		 383 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4009  metallophosphoesterase  53.72 
 
 		 383 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3950  metallophosphoesterase  54.08 
 
 		 383 aa  319  5e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838996  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4436  metallophosphoesterase  49.32 
 
 		 383 aa  316  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2463  metallophosphoesterase  44.88 
 
 		 385 aa  259  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23980  DNA repair exonuclease  42.09 
 
 		 379 aa  246  4.9999999999999997e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289668  normal  0.90712 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1937  metallophosphoesterase  36.74 
 
 		 375 aa  166  9e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.151993  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4995  metallophosphoesterase  32.35 
 
 		 378 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  30.79 
 
 		 377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  33.63 
 
 		 409 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  36.2 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  32.42 
 
 		 371 aa  138  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  31.71 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3141  metallophosphoesterase  29.76 
 
 		 375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496941  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  33.53 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5392  metallophosphoesterase  32.97 
 
 		 374 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  32.94 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5216  metallophosphoesterase  31.22 
 
 		 370 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  29.82 
 
 		 380 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2303  metallophosphoesterase  32.73 
 
 		 373 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0159679 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  32.28 
 
 		 374 aa  127  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2573  metallophosphoesterase  32.81 
 
 		 363 aa  123  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  29.66 
 
 		 445 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0908  exonuclease SbcD  31.68 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  26.7 
 
 		 404 aa  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1249  metallophosphoesterase  30.1 
 
 		 383 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  27.73 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  24.85 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  24.79 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  26.82 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  25.27 
 
 		 464 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1141  nuclease SbcCD, D subunit  21.99 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.37 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  29.32 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  25.29 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.6 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  24.24 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  24.58 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  24.92 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  28.37 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  24.24 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  24.72 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  24.39 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  24.38 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27860  DNA repair exonuclease  24.7 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1260  metallophosphoesterase  25.21 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00868935  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  25.45 
 
 		 380 aa  57  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  23.94 
 
 		 381 aa  57  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  25.33 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  26.05 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  27.08 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  27.94 
 
 		 425 aa  56.2  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  28.73 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  25.68 
 
 		 442 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  23.92 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  26.95 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  26.54 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  18.51 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  18.83 
 
 		 379 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  25 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  27.05 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  23.62 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  24.24 
 
 		 381 aa  54.7  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  24.11 
 
 		 381 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  24.11 
 
 		 381 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  24.62 
 
 		 409 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  28.02 
 
 		 386 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  29.17 
 
 		 406 aa  52.8  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  31.93 
 
 		 410 aa  52.8  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  26.09 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  28.89 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  23.91 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7589  metallophosphoesterase  25.98 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.691136 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2891  metallophosphoesterase  28.29 
 
 		 448 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  27.15 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  26.09 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  23.91 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.57 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  37.36 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.78 
 
 		 381 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  26.09 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  26.09 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  28.31 
 
 		 379 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  28.65 
 
 		 428 aa  50.4  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  26.39 
 
 		 432 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  25.33 
 
 		 432 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  24.53 
 
 		 409 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  26.39 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  28.52 
 
 		 366 aa  50.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  23.74 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  25.65 
 
 		 413 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  35.51 
 
 		 383 aa  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  26.32 
 
 		 397 aa  50.1  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  21.87 
 
 		 382 aa  49.7  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  28.19 
 
 		 375 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.89 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  28.96 
 
 		 423 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>