201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2303 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2303  metallophosphoesterase  100 
 
 		 373 aa  722    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0159679 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3141  metallophosphoesterase  50.95 
 
 		 375 aa  339  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496941  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4995  metallophosphoesterase  45.8 
 
 		 378 aa  298  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0908  exonuclease SbcD  45.08 
 
 		 374 aa  256  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1249  metallophosphoesterase  47.34 
 
 		 383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5392  metallophosphoesterase  42.9 
 
 		 374 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  45.61 
 
 		 374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  41.35 
 
 		 371 aa  222  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  41.62 
 
 		 380 aa  222  9e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2573  metallophosphoesterase  43.15 
 
 		 363 aa  215  8e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  42.22 
 
 		 380 aa  215  9e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  41.92 
 
 		 380 aa  212  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5216  metallophosphoesterase  42.47 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  37.9 
 
 		 377 aa  199  6e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  35.65 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  33.99 
 
 		 445 aa  157  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  37.13 
 
 		 361 aa  156  7e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  34.95 
 
 		 396 aa  149  8e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  33.44 
 
 		 404 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2463  metallophosphoesterase  31.94 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23980  DNA repair exonuclease  31.37 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289668  normal  0.90712 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11303  hypothetical protein  32.25 
 
 		 417 aa  119  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.42965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1217  metallophosphoesterase  31.95 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3935  metallophosphoesterase  33.44 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4009  metallophosphoesterase  33.44 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2255  metallophosphoesterase  31.29 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4436  metallophosphoesterase  29.86 
 
 		 383 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1937  metallophosphoesterase  30.94 
 
 		 375 aa  96.7  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.151993  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3950  metallophosphoesterase  33.11 
 
 		 383 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838996  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.69 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  30.3 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  32.26 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  31.09 
 
 		 375 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.24 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  32.26 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  32.26 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  32.26 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  32.26 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  32.26 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  24 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  28.92 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  25.35 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  22.18 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  22.18 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  25.31 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  36.56 
 
 		 498 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  26.25 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  29.68 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  29.68 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  29.68 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  29.68 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  29.68 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  29.68 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  29.68 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  29.68 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  39.66 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  22.54 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  33.67 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  26.42 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  28.68 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  27.82 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  28.05 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3216  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.47 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.92 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  25.25 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  30.24 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  29.03 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  33.56 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  24.9 
 
 		 379 aa  57  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  19.91 
 
 		 379 aa  57  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  28.57 
 
 		 515 aa  56.6  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  28.72 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  27.17 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  25.17 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.6 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  23.96 
 
 		 413 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  37.86 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0170  nuclease SbcCD, D subunit, putative  22.71 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  24.9 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  34.41 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  23.71 
 
 		 432 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  36.84 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  34.41 
 
 		 418 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  23.34 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.98 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  25.69 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  23.59 
 
 		 413 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  25.72 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  33.33 
 
 		 414 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  27.36 
 
 		 412 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  27.21 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  27.74 
 
 		 381 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  24.65 
 
 		 413 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  35.79 
 
 		 442 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  34.41 
 
 		 408 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  33.7 
 
 		 393 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.01 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.01 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  35.05 
 
 		 410 aa  53.5  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  27.74 
 
 		 381 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>