227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_13291 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  100 
 
 		 404 aa  823    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  41.39 
 
 		 445 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  38.99 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  34.84 
 
 		 374 aa  176  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  32.79 
 
 		 380 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  33.24 
 
 		 371 aa  162  9e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5216  metallophosphoesterase  33.81 
 
 		 370 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  32.74 
 
 		 380 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4995  metallophosphoesterase  32.21 
 
 		 378 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3141  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496941  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  33.33 
 
 		 377 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  32.44 
 
 		 380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2303  metallophosphoesterase  33.02 
 
 		 373 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0159679 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5392  metallophosphoesterase  31.58 
 
 		 374 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  28.96 
 
 		 361 aa  137  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  28.49 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0908  exonuclease SbcD  31.65 
 
 		 374 aa  120  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1249  metallophosphoesterase  30.06 
 
 		 383 aa  119  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2573  metallophosphoesterase  33.9 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1217  metallophosphoesterase  26.42 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2463  metallophosphoesterase  27.12 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11303  hypothetical protein  29 
 
 		 417 aa  101  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.42965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4436  metallophosphoesterase  28.75 
 
 		 383 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2255  metallophosphoesterase  28.96 
 
 		 382 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3935  metallophosphoesterase  28.62 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4009  metallophosphoesterase  28.62 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1937  metallophosphoesterase  27.18 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.151993  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3950  metallophosphoesterase  28.62 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838996  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23980  DNA repair exonuclease  28.12 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289668  normal  0.90712 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  28.09 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.68 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  30.07 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.78 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  27.27 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.74 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  26.39 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  25.49 
 
 		 372 aa  72.8  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  30.53 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  25.17 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  23.21 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  26.67 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  39.6 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  25.28 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  25.51 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  24.91 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  26.14 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  27.34 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  24.83 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  22.19 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  27.18 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  26.3 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  25.13 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  21.99 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  20.97 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  28.08 
 
 		 382 aa  66.6  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  24.83 
 
 		 506 aa  66.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  26.32 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  27.08 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  27.36 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  28.92 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  21.48 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  21.23 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  28.05 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  28.05 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  25.66 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  28.05 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  27.41 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  25.99 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  25.99 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  25.99 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  26.02 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  25.99 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  25.99 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  27.41 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  25.99 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  25.99 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  25.99 
 
 		 400 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  25.1 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.73 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  23.39 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  26.98 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  23.69 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  39.78 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  22.97 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  26.98 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  25.66 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  26.98 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  21.23 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.64 
 
 		 376 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0170  nuclease SbcCD, D subunit, putative  23.27 
 
 		 383 aa  62.8  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  26.98 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  24.8 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  28.35 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  34.78 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  24.32 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  26.39 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  25.37 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  20.97 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  28.88 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  24.43 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>