158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1235 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  100 
 
 		 380 aa  762    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  95 
 
 		 380 aa  710    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5216  metallophosphoesterase  67.92 
 
 		 370 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  54.3 
 
 		 380 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.46 
 
 		 371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  53.98 
 
 		 374 aa  351  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  47.4 
 
 		 377 aa  300  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4995  metallophosphoesterase  38.11 
 
 		 378 aa  216  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2303  metallophosphoesterase  41.92 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0159679 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3141  metallophosphoesterase  38.02 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496941  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5392  metallophosphoesterase  35.12 
 
 		 374 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0908  exonuclease SbcD  36.56 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1249  metallophosphoesterase  36.41 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  32.79 
 
 		 445 aa  156  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  34.22 
 
 		 409 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  31.85 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  34.32 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2573  metallophosphoesterase  33.25 
 
 		 363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  30.75 
 
 		 396 aa  134  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2463  metallophosphoesterase  30.29 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1217  metallophosphoesterase  32.65 
 
 		 379 aa  123  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1937  metallophosphoesterase  31.79 
 
 		 375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.151993  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23980  DNA repair exonuclease  29.58 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289668  normal  0.90712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4436  metallophosphoesterase  29.13 
 
 		 383 aa  94  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2255  metallophosphoesterase  28.32 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11303  hypothetical protein  28.85 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.42965  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  29.87 
 
 		 376 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3935  metallophosphoesterase  31.69 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4009  metallophosphoesterase  31.69 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  29.14 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3950  metallophosphoesterase  31.69 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838996  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  27.14 
 
 		 413 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  27.14 
 
 		 432 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  27.14 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  27.14 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  27.14 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  26.55 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  27.14 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  27.14 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  27.14 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  27.14 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  22.75 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  27.23 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  30.14 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  26.61 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  36.36 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  24.76 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  30.14 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  20.77 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.96 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  23.96 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  25.33 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  27.23 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  41.84 
 
 		 415 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  28.37 
 
 		 412 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  29.08 
 
 		 381 aa  53.1  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.35 
 
 		 465 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1881  nuclease SbcCD, D subunit  27.68 
 
 		 386 aa  53.1  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.459868 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1267  metallophosphoesterase  23.11 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.007502  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0348  nuclease SbcCD, D subunit  41.84 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  27.43 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  33.33 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  25.87 
 
 		 387 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  27.2 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  33.67 
 
 		 515 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  34.04 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  23.36 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  40.82 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  23.93 
 
 		 407 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  26.14 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  25.51 
 
 		 434 aa  50.8  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  34.78 
 
 		 406 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  36.08 
 
 		 381 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  25 
 
 		 381 aa  50.1  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  36.08 
 
 		 381 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  36.08 
 
 		 381 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  36.08 
 
 		 381 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  28.39 
 
 		 419 aa  49.7  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  29.34 
 
 		 386 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  26.9 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  32.63 
 
 		 409 aa  48.9  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  36.36 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  36.36 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  35.48 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  36.36 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  34.04 
 
 		 390 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  36.36 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  37.5 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  20.32 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  36.36 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  36.36 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  22.07 
 
 		 361 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  30.19 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  36.36 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  36.36 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  36.36 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  30.83 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0027  metallophosphoesterase  25 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.747459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  33.33 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  21.4 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>