290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1444 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  100 
 
 		 390 aa  798    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  48.51 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  37.91 
 
 		 372 aa  263  3e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  32.73 
 
 		 374 aa  199  5e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  29.85 
 
 		 388 aa  189  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  29.77 
 
 		 381 aa  187  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1434  nuclease SbcCD, D subunit  30.08 
 
 		 373 aa  184  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.395711  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1407  nuclease SbcCD, D subunit  30.08 
 
 		 373 aa  184  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0164036  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  29.08 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.5 
 
 		 400 aa  180  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  28 
 
 		 399 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.25 
 
 		 400 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  28 
 
 		 400 aa  176  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  28.26 
 
 		 381 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  29.59 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  27.76 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  27.76 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  27.76 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  29.8 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  27.76 
 
 		 381 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  27.14 
 
 		 381 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  27.86 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  31.08 
 
 		 375 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  27.11 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  27.92 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  28.04 
 
 		 385 aa  166  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1245  nuclease SbcCD, D subunit  27.96 
 
 		 375 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  28.54 
 
 		 380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  27.11 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  27.11 
 
 		 385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  27.11 
 
 		 385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  27.11 
 
 		 385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  27.11 
 
 		 385 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  27.11 
 
 		 385 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  26.87 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  26.9 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  26.08 
 
 		 379 aa  159  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  33.57 
 
 		 379 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  28.76 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  25.57 
 
 		 381 aa  155  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  31 
 
 		 386 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0085  nuclease SbcCD, D subunit  27.74 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  31.06 
 
 		 381 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  26.01 
 
 		 381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  26.49 
 
 		 383 aa  146  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  27.65 
 
 		 390 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  27.6 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01060  exonuclease SbcD  27.49 
 
 		 409 aa  145  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  27.07 
 
 		 390 aa  142  8e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  26.33 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  29.51 
 
 		 382 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.53 
 
 		 386 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  27.56 
 
 		 407 aa  137  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1889  nuclease SbcCD, D subunit  26.7 
 
 		 407 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0592363  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  28 
 
 		 371 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01260  Exodeoxyribonuclease I subunit D  26.6 
 
 		 394 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  23.75 
 
 		 387 aa  122  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0123  nuclease SbcCD, D subunit  25 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.694762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3945  ATP-dependent dsDNA exonuclease protein  28.57 
 
 		 379 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  26.67 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  29.21 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  27.3 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.3 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4361  nuclease SbcCD, D subunit  30.03 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.820345  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  26.37 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  27.41 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  25.59 
 
 		 409 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  29.08 
 
 		 405 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  29.74 
 
 		 393 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  28.67 
 
 		 388 aa  109  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  27.3 
 
 		 409 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  27.46 
 
 		 423 aa  106  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0170  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.47 
 
 		 383 aa  105  9e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  25.7 
 
 		 515 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  26.92 
 
 		 414 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  26.92 
 
 		 414 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  26.92 
 
 		 414 aa  102  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  28.41 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2390  exonuclease SbcD, putative  24.04 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.303161  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  28.26 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  28.78 
 
 		 435 aa  99.4  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  28.32 
 
 		 442 aa  98.6  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  27.82 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  26.73 
 
 		 407 aa  97.1  4e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  25.07 
 
 		 387 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  26.5 
 
 		 406 aa  96.7  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  29.39 
 
 		 382 aa  96.7  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  25.44 
 
 		 408 aa  96.3  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  25.35 
 
 		 425 aa  95.1  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  22.99 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  24.02 
 
 		 387 aa  94  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3776  nuclease SbcCD, D subunit  28.21 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0285977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  27.97 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  27.7 
 
 		 395 aa  91.3  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  26.19 
 
 		 410 aa  90.9  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  26.64 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  26.3 
 
 		 408 aa  90.5  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3442  exonuclease subunit SbcD  26.92 
 
 		 483 aa  89.7  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289654  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  24.85 
 
 		 400 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  27.69 
 
 		 413 aa  89.7  8e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>