179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4995 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4995  metallophosphoesterase  100 
 
 		 378 aa  762    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3141  metallophosphoesterase  47.83 
 
 		 375 aa  359  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496941  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2303  metallophosphoesterase  45.8 
 
 		 373 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0159679 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  41.33 
 
 		 371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1249  metallophosphoesterase  40.96 
 
 		 383 aa  232  1e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3043  metallophosphoesterase  39.07 
 
 		 380 aa  230  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5392  metallophosphoesterase  38.8 
 
 		 374 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0397  metallophosphoesterase  38.86 
 
 		 374 aa  216  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  38.83 
 
 		 380 aa  212  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0908  exonuclease SbcD  39.52 
 
 		 374 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.153594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  37.2 
 
 		 377 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  37.82 
 
 		 380 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5216  metallophosphoesterase  35.62 
 
 		 370 aa  199  9e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380368  normal  0.175599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0820  metallophosphoesterase  37.07 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0584655 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2573  metallophosphoesterase  37.13 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.212678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0994  DNA repair exonuclease  35.73 
 
 		 396 aa  176  8e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.821766  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13291  DNA repair exonuclease  32.21 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  33.23 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  34.66 
 
 		 361 aa  142  7e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1217  metallophosphoesterase  31.28 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2463  metallophosphoesterase  31.17 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23980  DNA repair exonuclease  29.92 
 
 		 379 aa  129  9.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.289668  normal  0.90712 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11303  hypothetical protein  28.3 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.42965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2255  metallophosphoesterase  26.54 
 
 		 382 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4436  metallophosphoesterase  25.07 
 
 		 383 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.209331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1937  metallophosphoesterase  26.95 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.151993  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3935  metallophosphoesterase  27.54 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4009  metallophosphoesterase  27.54 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3950  metallophosphoesterase  31.51 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.838996  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  28.51 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  27.65 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  23.3 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  22.65 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  24.69 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  30.92 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  26.18 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  27.16 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  26.4 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  28.35 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  31.13 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  24.29 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  26.85 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  26.85 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  26.41 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  26.89 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  26.89 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  26.89 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  26.89 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  26.89 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  26.89 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  26.89 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  26.82 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  26.8 
 
 		 419 aa  56.2  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  26.59 
 
 		 386 aa  56.2  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  26.97 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1148  metallophosphoesterase  26.27 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.809261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  41.3 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  24.25 
 
 		 413 aa  54.7  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  26.43 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  25.12 
 
 		 413 aa  54.3  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2831  metallophosphoesterase  26.15 
 
 		 408 aa  53.9  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1185  metallophosphoesterase  26.92 
 
 		 408 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  26.12 
 
 		 386 aa  53.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  23.7 
 
 		 422 aa  53.1  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  36.26 
 
 		 414 aa  53.1  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  24.35 
 
 		 435 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  38.04 
 
 		 442 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  22.19 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0170  nuclease SbcCD, D subunit, putative  20.86 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  29.2 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3627  metallophosphoesterase  25.2 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0630322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.91 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  26.49 
 
 		 407 aa  50.4  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  34.78 
 
 		 400 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  34.78 
 
 		 400 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  34.78 
 
 		 400 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  34.78 
 
 		 400 aa  50.1  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  34.78 
 
 		 400 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  34.78 
 
 		 400 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  34.78 
 
 		 400 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  34.78 
 
 		 400 aa  50.1  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  34.17 
 
 		 423 aa  49.7  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  28.04 
 
 		 390 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  34.78 
 
 		 400 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.81 
 
 		 418 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  36.36 
 
 		 390 aa  49.7  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  25.48 
 
 		 412 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  36.26 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  34.74 
 
 		 410 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  31.58 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  25.1 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  30.93 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  28.81 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  24.14 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  34.07 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1093  putative exonuclease  27.64 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.144475  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  34.07 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  23.53 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  34.07 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  34.07 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>