195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1100 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1100  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 		 537 aa  1108    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  58.54 
 
 		 528 aa  603  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  58.41 
 
 		 517 aa  601  1e-170  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  61.68 
 
 		 414 aa  356  5e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  59.01 
 
 		 409 aa  356  5.999999999999999e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  60.22 
 
 		 418 aa  350  3e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  53.02 
 
 		 498 aa  343  5.999999999999999e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  54.04 
 
 		 416 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  56.57 
 
 		 408 aa  320  3e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  55.27 
 
 		 409 aa  318  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  53.82 
 
 		 411 aa  317  4e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  53.65 
 
 		 410 aa  302  9e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  50.55 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  49.47 
 
 		 410 aa  301  2e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  46.55 
 
 		 404 aa  240  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  44.53 
 
 		 423 aa  239  8e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  42.18 
 
 		 515 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  43.07 
 
 		 412 aa  232  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3442  exonuclease subunit SbcD  41.72 
 
 		 483 aa  231  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289654  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  43.4 
 
 		 414 aa  230  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  43.68 
 
 		 410 aa  229  8e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  43.77 
 
 		 414 aa  227  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  40.57 
 
 		 408 aa  227  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  43.77 
 
 		 414 aa  227  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  43.77 
 
 		 414 aa  227  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  41.97 
 
 		 408 aa  223  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  40.71 
 
 		 414 aa  221  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  39.72 
 
 		 506 aa  219  7e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  42.45 
 
 		 442 aa  219  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  40.88 
 
 		 410 aa  217  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  43.32 
 
 		 400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  43.68 
 
 		 400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  43.32 
 
 		 400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  41.61 
 
 		 410 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  43.68 
 
 		 400 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  43.32 
 
 		 400 aa  213  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  41.52 
 
 		 406 aa  212  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  43.07 
 
 		 400 aa  210  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  41.96 
 
 		 401 aa  210  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  42.7 
 
 		 400 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  42.7 
 
 		 400 aa  208  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  42.7 
 
 		 400 aa  208  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  42.7 
 
 		 400 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  42.7 
 
 		 400 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  42.7 
 
 		 400 aa  208  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  42.7 
 
 		 400 aa  208  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  42.7 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  40.88 
 
 		 406 aa  201  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  40.78 
 
 		 425 aa  199  9e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  39.43 
 
 		 425 aa  197  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  39.72 
 
 		 409 aa  190  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  40.42 
 
 		 409 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  35.92 
 
 		 412 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  35.92 
 
 		 412 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3216  exodeoxyribonuclease I subunit D  37.24 
 
 		 414 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1585  nuclease SbcCD, D subunit  36.46 
 
 		 412 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583238  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1822  nuclease SbcCD, D subunit  36.83 
 
 		 467 aa  173  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1557  nuclease SbcCD, D subunit  36.46 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436101  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3765  exonuclease SbcD  36.1 
 
 		 414 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0831731  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0468  nuclease SbcCD, D subunit  38.71 
 
 		 417 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1715  exonuclease SbcD  35.42 
 
 		 414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4885  nuclease SbcCD, D subunit  34.89 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.788581 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0434  exodeoxyribonuclease I subunit D  37.97 
 
 		 428 aa  160  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0609998  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  31.06 
 
 		 407 aa  159  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  35.46 
 
 		 418 aa  152  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0463  nuclease SbcCD, D subunit  37.94 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165432  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  32.78 
 
 		 415 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  34.29 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  33.1 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0348  nuclease SbcCD, D subunit  33.1 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  34.67 
 
 		 379 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1639  nuclease SbcCD, D subunit  32.73 
 
 		 381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0728377  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  32.38 
 
 		 393 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  28.43 
 
 		 377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1654  nuclease SbcCD, D subunit  32.36 
 
 		 381 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0985231  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  29.24 
 
 		 379 aa  127  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2704  nuclease SbcCD, D subunit  32.48 
 
 		 381 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0939258  hitchhiker  0.00000562374 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1676  nuclease SbcCD, D subunit  32.48 
 
 		 381 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106727  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  33.45 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1531  nuclease SbcCD, D subunit  32.01 
 
 		 381 aa  126  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0738681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  33.57 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.42 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  33.09 
 
 		 380 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2450  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.81 
 
 		 400 aa  124  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.982137  unclonable  0.000000000023362 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  32.47 
 
 		 382 aa  124  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  32.47 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  35.23 
 
 		 418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  35.16 
 
 		 386 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1588  nuclease SbcCD, D subunit  30.43 
 
 		 381 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  29.82 
 
 		 435 aa  121  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  32.65 
 
 		 408 aa  121  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  31.8 
 
 		 386 aa  120  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  33.45 
 
 		 387 aa  120  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  28.36 
 
 		 413 aa  120  7.999999999999999e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.33 
 
 		 400 aa  119  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  33.69 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  31.65 
 
 		 399 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  31.75 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  30.72 
 
 		 425 aa  118  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3945  ATP-dependent dsDNA exonuclease protein  34.55 
 
 		 379 aa  117  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>