201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2569 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2569  nuclease SbcCD, D subunit  100 
 
 		 410 aa  834    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1979  nuclease SbcCD, D subunit  75.37 
 
 		 409 aa  648    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0703  exonuclease SbcD  60.14 
 
 		 418 aa  509  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0203  nuclease SbcCD, D subunit  58.52 
 
 		 409 aa  503  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738096  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  60.88 
 
 		 414 aa  502  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2541  nuclease SbcCD, D subunit  48.48 
 
 		 498 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1731  exonuclease  53.09 
 
 		 408 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1371  exodeoxyribonuclease I subunit D  50.86 
 
 		 416 aa  422  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1319  nuclease SbcCD, D subunit  51.6 
 
 		 411 aa  413  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1159  nuclease SbcCD, D subunit  49.01 
 
 		 410 aa  403  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.067261  normal  0.815946 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  47.17 
 
 		 410 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1064  exodeoxyribonuclease I subunit D  50.5 
 
 		 528 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1398  nuclease SbcCD, D subunit  52.92 
 
 		 517 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1100  nuclease SbcCD, D subunit  53.65 
 
 		 537 aa  309  5e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  40.57 
 
 		 414 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1040  exonuclease subunit SbcD  37.65 
 
 		 410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  37.66 
 
 		 408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  36.79 
 
 		 425 aa  280  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  38.77 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  37.5 
 
 		 401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  36.97 
 
 		 423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3138  exonuclease subunit SbcD  35.77 
 
 		 414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  36.53 
 
 		 412 aa  272  9e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3288  exonuclease subunit SbcD  35.52 
 
 		 414 aa  271  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3277  exonuclease subunit SbcD  35.52 
 
 		 414 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2636  exonuclease subunit SbcD  40 
 
 		 406 aa  271  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201368  normal  0.0691306 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  37.84 
 
 		 400 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  37.84 
 
 		 400 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  37.84 
 
 		 400 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  38.96 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  37.59 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  37.59 
 
 		 400 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11540  exonuclease subunit SbcD  41.64 
 
 		 406 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  36.55 
 
 		 408 aa  266  7e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2916  nuclease SbcCD, D subunit  38.62 
 
 		 410 aa  265  8e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  36.88 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  36.63 
 
 		 400 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  36.63 
 
 		 400 aa  263  6e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  36.63 
 
 		 400 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  36.63 
 
 		 400 aa  263  6e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  36.63 
 
 		 400 aa  263  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  36.63 
 
 		 400 aa  263  6e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  36.39 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1332  exonuclease subunit SbcD  35.88 
 
 		 414 aa  261  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  36.63 
 
 		 400 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  36.82 
 
 		 410 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03136  exonuclease SbcD  34.29 
 
 		 515 aa  259  6e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0895  exonuclease subunit SbcD  38.82 
 
 		 425 aa  249  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2849  exonuclease subunit SbcD  35.38 
 
 		 506 aa  248  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.482559  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3442  exonuclease subunit SbcD  33.87 
 
 		 483 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.289654  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4885  nuclease SbcCD, D subunit  36.64 
 
 		 414 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.788581 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55640  exonuclease SbcD  31.98 
 
 		 409 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000128845  normal  0.404134 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4848  exonuclease SbcD  32.24 
 
 		 409 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000186512  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1557  nuclease SbcCD, D subunit  31.98 
 
 		 412 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.436101  normal  0.347672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  32.06 
 
 		 412 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0468  nuclease SbcCD, D subunit  39 
 
 		 417 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  31.16 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  27.88 
 
 		 407 aa  171  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1822  nuclease SbcCD, D subunit  35.29 
 
 		 467 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0434  exodeoxyribonuclease I subunit D  39 
 
 		 428 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0609998  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1585  nuclease SbcCD, D subunit  30.62 
 
 		 412 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583238  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0463  nuclease SbcCD, D subunit  37.75 
 
 		 419 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3216  exodeoxyribonuclease I subunit D  30.9 
 
 		 414 aa  160  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569023 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  32.58 
 
 		 392 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  34.58 
 
 		 393 aa  156  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2961  nuclease SbcCD, D subunit  36.9 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0847244  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3765  exonuclease SbcD  30.77 
 
 		 414 aa  152  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0831731  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  35.14 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0348  nuclease SbcCD, D subunit  35.47 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1715  exonuclease SbcD  31.04 
 
 		 414 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  34.12 
 
 		 418 aa  149  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  34.11 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2574  exodeoxyribonuclease I subunit D  37.33 
 
 		 390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0858  putative Exonuclease SbcD homolog  27.22 
 
 		 413 aa  140  6e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  35.26 
 
 		 387 aa  139  8.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  27.49 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  31.94 
 
 		 425 aa  133  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  31.8 
 
 		 405 aa  133  5e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08410  Exodeoxyribonuclease I subunit D  37.55 
 
 		 407 aa  133  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  33.63 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  31.61 
 
 		 382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  32.34 
 
 		 390 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1226  exodeoxyribonuclease I subunit D  35.1 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0802336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31450  Exodeoxyribonuclease I subunit D  35.45 
 
 		 386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.603328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  33 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04020  Exodeoxyribonuclease I subunit D  29.64 
 
 		 435 aa  127  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0356343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  31.32 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01260  Exodeoxyribonuclease I subunit D  37.83 
 
 		 394 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  34.68 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  31.36 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  30.58 
 
 		 377 aa  123  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  31.35 
 
 		 387 aa  123  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2306  nuclease SbcCD, D subunit  33.03 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794517 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  26.59 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  32.01 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  26.59 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  33.11 
 
 		 383 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  28.1 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2520  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.09 
 
 		 400 aa  121  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0230667  unclonable  0.0000259601 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  28.76 
 
 		 381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>