122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1037 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_1037  metallophosphoesterase  100 
 
 
362 aa  738    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0714312  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0896  metallophosphoesterase  37.91 
 
 
402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  27.67 
 
 
376 aa  86.3  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  23.79 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  27.5 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  24.13 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  24.13 
 
 
413 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  24.03 
 
 
432 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  22.9 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  23.37 
 
 
413 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  23.78 
 
 
413 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  23.45 
 
 
413 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  24.13 
 
 
413 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  23.67 
 
 
432 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  23.78 
 
 
413 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  23.26 
 
 
432 aa  60.1  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3282  metallophosphoesterase  22.84 
 
 
368 aa  59.7  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  23.86 
 
 
408 aa  58.9  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  25.4 
 
 
374 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1662  metallophosphoesterase  21.99 
 
 
429 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185631  normal  0.706151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0443  metallophosphoesterase  22.5 
 
 
411 aa  57  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1299  nuclease SbcCD, D subunit  25.43 
 
 
382 aa  57  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.894732  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0031  metallophosphoesterase  27.13 
 
 
379 aa  57  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1156  nuclease SbcCD, D subunit  25.43 
 
 
382 aa  56.6  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1789  metallophosphoesterase  23.86 
 
 
409 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2416  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.97 
 
 
379 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  22.37 
 
 
337 aa  54.3  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2127  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.54 
 
 
379 aa  54.3  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  23.16 
 
 
393 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0070  phosphoesterase  23.57 
 
 
422 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0902  DNA repair exonuclease  24.6 
 
 
413 aa  51.6  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.175576  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  32.69 
 
 
408 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  24.18 
 
 
442 aa  50.4  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1060  DNA repair exonuclease  22.51 
 
 
370 aa  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00537439  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1032  nuclease SbcCD, D subunit  23.85 
 
 
372 aa  49.7  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27310  Exodeoxyribonuclease I subunit D  24.19 
 
 
387 aa  49.7  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00866109  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  24.76 
 
 
449 aa  49.7  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  24.11 
 
 
435 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  23.31 
 
 
402 aa  48.9  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2356  exonuclease subunit SbcD  23.42 
 
 
425 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0206  putative nuclease SbcCD, D subunit  36.05 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.700221  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0204  nuclease SbcCD, D subunit, putative  36.05 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.234178  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1861  metallophosphoesterase  35.87 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0744481  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  20.12 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  22.83 
 
 
385 aa  47.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  22.15 
 
 
416 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  20.25 
 
 
425 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  22.05 
 
 
392 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  36.05 
 
 
406 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  21.37 
 
 
383 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1689  metallophosphoesterase  21.25 
 
 
361 aa  47  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  24.68 
 
 
371 aa  47  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0102  metallophosphoesterase  24.51 
 
 
361 aa  47  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  22.94 
 
 
422 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3623  Ser/Thr protein phosphatase family protein  20.96 
 
 
465 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3776  nuclease SbcCD, D subunit  22.83 
 
 
387 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0285977  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0391  DNA repair exonuclease  25.13 
 
 
283 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.903131  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  21.88 
 
 
381 aa  46.6  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  25.61 
 
 
410 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  25.38 
 
 
390 aa  46.2  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  32.94 
 
 
405 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0509  metallophosphoesterase  23.24 
 
 
355 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3945  ATP-dependent dsDNA exonuclease protein  25.17 
 
 
379 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6632  metallophosphoesterase  21.91 
 
 
416 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000403777  normal  0.125865 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2079  nuclease SbcCD, D subunit  25.54 
 
 
410 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.655722  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  30.3 
 
 
381 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1745  metallophosphoesterase  22.83 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  23.53 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  21.73 
 
 
409 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1764  metallophosphoesterase  20.72 
 
 
377 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244861  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2438  metallophosphoesterase  20.66 
 
 
405 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3107  nuclease SbcCD, D subunit  21.32 
 
 
410 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1380  DNA repair exonuclease family protein  21.83 
 
 
398 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00026771  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1921  hypothetical protein  22.73 
 
 
269 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  22.15 
 
 
416 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  22.47 
 
 
379 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1710  metallophosphoesterase  23.87 
 
 
282 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.721564  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  24.58 
 
 
381 aa  44.3  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  23.9 
 
 
400 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1007  exonuclease subunit SbcD  22.71 
 
 
412 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1934  hypothetical protein  23.05 
 
 
270 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  22.22 
 
 
416 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  22.22 
 
 
416 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  22.3 
 
 
404 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0282  nuclease SbcCD, D subunit  27.59 
 
 
425 aa  43.9  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1227  Ser/Thr protein phosphatase family protein  19.93 
 
 
371 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  20.6 
 
 
381 aa  43.5  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1897  metallophosphoesterase  25.9 
 
 
398 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1931  metallophosphoesterase  25.9 
 
 
398 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  31.78 
 
 
386 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  28.24 
 
 
382 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  20.73 
 
 
375 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  22.52 
 
 
421 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0051  nuclease SbcCD, D subunit  23.28 
 
 
388 aa  43.5  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  29.21 
 
 
390 aa  43.5  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2385  nuclease SbcCD, D subunit  29.41 
 
 
388 aa  43.1  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000242417  hitchhiker  0.000411821 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  20.87 
 
 
453 aa  43.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  28.24 
 
 
382 aa  43.1  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3141  metallophosphoesterase  25 
 
 
375 aa  43.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.496941  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3303  exonuclease subunit SbcD  23.38 
 
 
408 aa  43.1  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>