186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0761 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0761  metallophosphoesterase  100 
 
 
379 aa  766    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.0154389 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  45.95 
 
 
381 aa  326  5e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1244  metallophosphoesterase  30.45 
 
 
380 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  27.3 
 
 
371 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  26.05 
 
 
375 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  25.7 
 
 
380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  29.6 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  25 
 
 
372 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  25.13 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2790  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  26.67 
 
 
421 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  26.52 
 
 
421 aa  77  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2263  metallophosphoesterase  27.24 
 
 
412 aa  77  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1502  metallophosphoesterase  33.5 
 
 
485 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1080  metallophosphoesterase  26.4 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000000806376  normal  0.987184 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  27.89 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  30.97 
 
 
776 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  28.3 
 
 
386 aa  67  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0182  metallophosphoesterase  29.1 
 
 
436 aa  66.2  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  24.62 
 
 
435 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  27.34 
 
 
380 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2438  metallophosphoesterase  34.94 
 
 
479 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1223  metallophosphoesterase  28.38 
 
 
376 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000483275 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1573  metallophosphoesterase  26.79 
 
 
391 aa  65.1  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.331746  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0301  metallophosphoesterase  26.95 
 
 
386 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0357  metallophosphoesterase  26.94 
 
 
385 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  35 
 
 
372 aa  64.7  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1820  metallophosphoesterase  25.98 
 
 
386 aa  64.3  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00514924  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1724  nuclease SbcCD, D subunit, putative  24.55 
 
 
418 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.559554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06370  metallophosphoesterase  24.7 
 
 
464 aa  63.5  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356218  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3493  metallophosphoesterase  26.82 
 
 
410 aa  63.5  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1374  ATP-dependent dsDNA exonuclease  22.65 
 
 
421 aa  63.2  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6381  metallophosphoesterase  24.89 
 
 
422 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.446574 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3015  metallophosphoesterase  27.35 
 
 
449 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.499435  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2899  metallophosphoesterase  34.19 
 
 
421 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0370  metallophosphoesterase  28.65 
 
 
469 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.976687  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1252  DNA repair protein RAD32-like  29.95 
 
 
425 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00368978  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1460  metallophosphoesterase  24.75 
 
 
419 aa  60.8  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1625  metallophosphoesterase  24.82 
 
 
392 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.504107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1109  DNA repair exonuclease family protein  23.5 
 
 
413 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1178  DNA repair exonuclease family protein  23.5 
 
 
413 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.955279  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0984  metallophosphoesterase  25.81 
 
 
384 aa  60.8  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000094413 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1052  metallophosphoesterase  26.32 
 
 
416 aa  60.5  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1212  metallophosphoesterase  25.1 
 
 
415 aa  60.8  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  36.56 
 
 
375 aa  60.5  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  27.14 
 
 
374 aa  59.7  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0925  metallophosphoesterase  23.24 
 
 
413 aa  59.7  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  24.89 
 
 
453 aa  59.7  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0918  DNA repair exonuclease  23.24 
 
 
432 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1050  DNA repair exonuclease family protein  23.04 
 
 
413 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.782479  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0732  nuclease SbcCD, D subunit  26.7 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0943  DNA repair exonuclease family protein  23.5 
 
 
432 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0931  DNA repair exonuclease  22.98 
 
 
432 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1008  DNA repair exonuclease family protein  23.5 
 
 
413 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0736  metallophosphoesterase  22.76 
 
 
435 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00547019  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1653  metallophosphoesterase  25.81 
 
 
270 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4251  DNA repair exonuclease family protein  22.98 
 
 
413 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236755 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1084  DNA repair exonuclease family protein  23.68 
 
 
413 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2742100000000004e-56 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0714  nuclease SbcCD, D subunit  22.5 
 
 
415 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  23.31 
 
 
380 aa  57.4  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  27.17 
 
 
428 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0019  metallophosphoesterase  25.27 
 
 
438 aa  57  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.044517 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1365  ATP-dependent dsDNA exonuclease  27.68 
 
 
402 aa  56.6  0.0000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.9573  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  35.71 
 
 
387 aa  56.2  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5895  nuclease SbcCD, D subunit  33.96 
 
 
408 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000840952  normal  0.0299962 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0794  metallophosphoesterase  25.75 
 
 
413 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1914  nuclease SbcCD, D subunit  32.26 
 
 
390 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0281047  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1494  metallophosphoesterase  30.34 
 
 
488 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  21.82 
 
 
415 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1000  phosphoesterase YhaO-putative DNA repair exonuclease  25.47 
 
 
416 aa  54.3  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  27.27 
 
 
395 aa  54.7  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1990  metallophosphoesterase  24.59 
 
 
425 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.217213  normal  0.336367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1497  nuclease SbcCD, D subunit  30.43 
 
 
382 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.231622  hitchhiker  0.000221272 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5855  metallophosphoesterase  26.19 
 
 
416 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0663703  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6221  metallophosphoesterase  26.19 
 
 
416 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799134  hitchhiker  0.00232711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1552  nuclease SbcCD, D subunit  29.71 
 
 
382 aa  54.3  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.787205 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1421  nuclease SbcCD, D subunit, putative  26.52 
 
 
376 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3216  putative DNA repair exonuclease  24.15 
 
 
418 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0672  nuclease SbcCD, D subunit  22.72 
 
 
393 aa  53.9  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1450  DNA repair exonuclease  23.37 
 
 
407 aa  53.9  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  26.36 
 
 
379 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_694  DNA repair exonuclease  21.53 
 
 
415 aa  53.9  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6697  metallophosphoesterase  26.19 
 
 
416 aa  53.5  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000065461  normal  0.239788 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2411  metallophosphoesterase  24.56 
 
 
381 aa  53.5  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5506  metallophosphoesterase  24.56 
 
 
425 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  hitchhiker  0.0000451519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5734  metallophosphoesterase  27.06 
 
 
416 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.458134  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0697  metallophosphoesterase  23.15 
 
 
387 aa  53.1  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0520  nuclease SbcCD, D subunit  26.73 
 
 
371 aa  53.1  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3955  metallophosphoesterase  24.15 
 
 
418 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0346  metallophosphoesterase  23.92 
 
 
418 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.45133  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0878  metallophosphoesterase  23.25 
 
 
425 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0628  nuclease SbcCD, D subunit  26.72 
 
 
385 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.013566  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5979  metallophosphoesterase  26.67 
 
 
416 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2340  metallophosphoesterase  27.27 
 
 
423 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187911 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1575  metallophosphoesterase  25.21 
 
 
270 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  26.09 
 
 
423 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1487  nuclease SbcCD, D subunit  24.78 
 
 
392 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0726  metallophosphoesterase  24.42 
 
 
412 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252632  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0161  metallophosphoesterase  23.81 
 
 
410 aa  50.8  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.254064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3506  nuclease SbcCD, D subunit  32.95 
 
 
406 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>