182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0357 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0357  metallophosphoesterase  100 
 
 		 385 aa  774    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0301  metallophosphoesterase  70.54 
 
 		 386 aa  578  1e-164  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0984  metallophosphoesterase  66.93 
 
 		 384 aa  551  1e-156  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000094413 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1820  metallophosphoesterase  71.58 
 
 		 386 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00514924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1080  metallophosphoesterase  29.33 
 
 		 405 aa  132  6.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000000000806376  normal  0.987184 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0493  metallophosphoesterase  37.68 
 
 		 382 aa  87.4  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0069  metallophosphoesterase  28.83 
 
 		 381 aa  86.7  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4367  metallophosphoesterase  27.51 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.544577  normal  0.383536 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2899  metallophosphoesterase  32.17 
 
 		 421 aa  76.3  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.784914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3452  nuclease SbcCD, D subunit  24.43 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.527539  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0238  metallophosphoesterase  26.82 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0913637  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0651  metallophosphoesterase  26.97 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.179823  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1252  DNA repair protein RAD32-like  26.98 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00368978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1502  metallophosphoesterase  24.92 
 
 		 485 aa  72  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2193  nuclease SbcCD, D subunit  25 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0979065  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0585  metallophosphoesterase  21.73 
 
 		 371 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0233441 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0940  metallophosphoesterase  24.55 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.282172  normal  0.704888 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0761  metallophosphoesterase  26.64 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1244  metallophosphoesterase  22.72 
 
 		 380 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1333  metallophosphoesterase  25 
 
 		 372 aa  67  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.309715  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0712  metallophosphoesterase  39.53 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000226711  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1304  nuclease SbcCD, D subunit  25 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.611964  normal  0.601138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0359  DNA repair protein  29.45 
 
 		 776 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.896103 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0449  metallophosphoesterase  27.78 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1873  metallophosphoesterase  24.07 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1483  metallophosphoesterase  24.82 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0393867  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0947  metallophosphoesterase  22.7 
 
 		 372 aa  62  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00156197  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2302  metallophosphoesterase  26.82 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0370  metallophosphoesterase  37.65 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.976687  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0182  metallophosphoesterase  28.87 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1444  DNA repair exonuclease  21.52 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.403487  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2438  metallophosphoesterase  30.77 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2367  nuclease SbcCD, D subunit  24.18 
 
 		 408 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0953909  normal  0.605774 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1616  metallophosphoesterase  24.83 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.170078  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0854  metallophosphoesterase  27.43 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1921  metallophosphoesterase  25.67 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.666866 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2790  metallophosphoesterase  36.9 
 
 		 404 aa  57  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6132  nuclease SbcCD, D subunit  37.65 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1494  metallophosphoesterase  30.77 
 
 		 488 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1653  metallophosphoesterase  27.36 
 
 		 270 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337571  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1813  metallophosphoesterase  30.33 
 
 		 261 aa  53.9  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00110244  normal  0.670349 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10600  exonuclease SbcD  33.72 
 
 		 381 aa  53.5  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000211311 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2145  nuclease SbcCD, D subunit  29.34 
 
 		 386 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0525294  normal  0.028692 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2571  metallophosphoesterase  25.79 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2167  nuclease SbcCD subunit D  24.32 
 
 		 366 aa  52.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0348  nuclease SbcCD, D subunit  28.81 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0824  nuclease SbcCD, D subunit  38.14 
 
 		 395 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0380  nuclease SbcCD, D subunit  27.97 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.061787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0304  nuclease SbcCD, D subunit  27.97 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.919689  normal  0.177579 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0453  putative exonuclease SbcD  37.93 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  25.73 
 
 		 423 aa  51.2  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0917  exonuclease SbcD  22.07 
 
 		 374 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0424463  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0749  metallophosphoesterase  24.71 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2634  nuclease SbcCD, D subunit  33.33 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3663  dsDNA exonuclease SbcC  25.44 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3061  nuclease SbcCD, D subunit  28.44 
 
 		 381 aa  50.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.749747  normal  0.0113326 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1822  nuclease SbcCD, D subunit  31.86 
 
 		 467 aa  50.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449676  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1249  metallophosphoesterase  35.56 
 
 		 383 aa  50.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5582  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.78 
 
 		 381 aa  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.403776  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000032  exonuclease SbcD  36.78 
 
 		 377 aa  49.7  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.526134  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1419  nuclease SbcCD, D subunit  28.7 
 
 		 407 aa  49.7  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.366401  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0776  metallophosphoesterase  21.85 
 
 		 337 aa  49.7  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2452  exonuclease subunit SbcD  33.72 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0983  nuclease SbcCD subunit D  26.77 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6452  nuclease SbcCD, D subunit  26.32 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.230494  normal  0.0467767 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1920  exonuclease subunit SbcD  33.7 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0479  metallophosphoesterase  23.99 
 
 		 374 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1267  exonuclease SbcD, putative  34.48 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0520829  hitchhiker  0.000185211 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0204  nuclease SbcCD, D subunit  32.56 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0788  nuclease SbcCD, D subunit  25.56 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2198  exonuclease SbcD  27.78 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.10356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2135  exonuclease SbcD  27.78 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.013389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2121  exonuclease  27.78 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2359  exonuclease SbcD  27.78 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1150  exodeoxyribonuclease I subunit D  26.56 
 
 		 418 aa  47.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0273  nuclease SbcCD, D subunit  33.01 
 
 		 412 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2821  nuclease SbcCD, D subunit  23.78 
 
 		 383 aa  47.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2378  putative exonuclease SbcD  27.78 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0567  nuclease SbcCD, D subunit  37.08 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2457  nuclease SbcCD, D subunit  27.78 
 
 		 380 aa  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.529794  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2460  putative exonuclease SbcD  27.78 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230426  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05653  hypothetical protein  35.63 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2844  exonuclease SbcD, putative  32.18 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1090  nuclease SbcCD, D subunit  34.48 
 
 		 380 aa  47.8  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2612  exodeoxyribonuclease I subunit D  33.33 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.84718  decreased coverage  0.00000000344007 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3542  exonuclease subunit SbcD  24.71 
 
 		 404 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.113465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2325  putative exonuclease SbcD  27.78 
 
 		 385 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5377  metallophosphoesterase  28.24 
 
 		 380 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.31329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1923  nuclease SbcCD, D subunit  33.01 
 
 		 379 aa  47.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0918656  decreased coverage  0.000244242 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2166  nuclease SbcCD, D subunit  31.03 
 
 		 385 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226896  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0759  nuclease SbcCD, D subunit  33.33 
 
 		 409 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2999  putative exonuclease SbcD  29.89 
 
 		 385 aa  47  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.141006  normal  0.0321972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1475  nuclease SbcCD, D subunit  24.73 
 
 		 442 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0190739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1735  nuclease SbcCD, D subunit  31.03 
 
 		 385 aa  46.6  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.053148  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1235  putative exonuclease  28.24 
 
 		 380 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402461  normal  0.467489 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1390  metallophosphoesterase  30 
 
 		 324 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.132933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2025  nuclease SbcCD, D subunit  31.46 
 
 		 412 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4030  nuclease SbcCD, D subunit  32.56 
 
 		 387 aa  46.6  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3717  nuclease SbcCD, D subunit  31.46 
 
 		 412 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0866  exonuclease subunit SbcD  30.59 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0618709  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>