17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4568 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4568  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  551  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.655382 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2890  metallophosphoesterase  26.64 
 
 
221 aa  72  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3641  metallophosphoesterase  24.23 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577036 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2620  metallophosphoesterase  31.14 
 
 
235 aa  63.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.534657  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0653  metallophosphoesterase  34.67 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0537  metallophosphoesterase  32 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2514  serine/threonine protein phosphatase family protein  25.35 
 
 
225 aa  53.1  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.221485  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0270  metallophosphoesterase  26.32 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.407111  normal  0.0834706 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0035  metallophosphoesterase  30.43 
 
 
222 aa  50.4  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.525214  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3968  metallophosphoesterase  29.66 
 
 
207 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0984  metallophosphoesterase  22.48 
 
 
226 aa  46.6  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0988  metallophosphoesterase  21.27 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.165399  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1723  metallophosphoesterase  22.17 
 
 
210 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1254  metallophosphoesterase  24.76 
 
 
214 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1512  metallophosphoesterase  24.41 
 
 
210 aa  42.7  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000329408 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2617  metallophosphoesterase  30.34 
 
 
240 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0194  metallophosphoesterase  27.83 
 
 
208 aa  42.4  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>